肠道菌群样品送样要求和质控标准

肠道菌群样品送样要求和质控标准

DNA样品:

请注明浓度和送样体积。样品保存期间切忌反复冻融,低温运输。

质量要求:浓度>10ng/ul,体积>20ul,A260/A280应在1.5至2.0之间;(若样品中其他干扰性DNA含量较多,如组织DNA,请提高送样量)

电泳检测:主带明显,无明显RNA条带。若是可以,请提供质量检测相关数据和图片,如:Nanodrop仪器检测数据或电泳胶图。

——不符合要求的DNA样品须第一时间与客户沟通,待客户答复后再做处理。(不保证测序周期)

处理方法:重新送样,或者尝试扩增。

重新送样处理的样品,测序周期重新计算;

尝试扩增处理的样品,不保证实验结果和实验周期。

粪便样品:

  • 不含样品保存液/裂解液的样品

此类样品仅适用于小鼠、大鼠等样品。切记此类样品必须低温运输(非低温可能导致样品中菌群分布发生变化),否则不保证测序数据的真实性。

  • 含样品保存液/裂解液的样品
  • 合格样品

粪便大小适中(黄豆大小),样品管中含有大量保存液/裂解液。

例,颗粒状粪便取样量视大小而定,如小鼠粪便2粒、大鼠粪便1~2粒;

人等动物的粪便样品参照取样说明,规范取样。

  • 问题样品

Ⅰ、不合格样品:

样品管内液体无明显颜色变化,且无固体存在——视为不合格样品

样品管中样品量过多,保存液/裂解液过少、或者没有——视为不合格样品

Ⅱ、可尝试扩增样品:可尝试扩增;若未扩增成功,须三天内反馈给客户

样品管内液体有明显颜色变化,但含有类胶体物质——视为可尝试样品

样品管内液体有明显颜色变化,但无固体存在,且总体积少于200ul——视为可尝试样品

寄送要求:

低温寄送:不含样品保存液的样品,必须低温寄送。如果使用冰袋,寄送时间不超过48h ;如果使用干冰,寄送时间不超过72h。

常温寄送:含有样品保存液的样品选择常温寄送。

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