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正确认识肠道内脆弱拟杆菌——其在健康的阴暗面和光明面

谷禾健康

弱拟杆菌(Bacteroides fragilis)是拟杆菌门拟杆菌属的重要成员。事实上,脆弱拟杆菌因其免疫调节功能而成为该属中研究最多的共生微生物。它是革兰氏阴性不形成孢子杆状专性厌氧菌。在人类健康中扮演着复杂而双面的角色。

这种革兰氏阴性专性厌氧菌常见于人类肠道菌群中,但也在口腔上呼吸道女性生殖道中检测到。第一个发现的脆弱拟杆菌菌株是从感染患者体内作为病原体分离出来的,随后的研究表明,该物种经常在患有各种炎症性疾病的患者中检测到,例如腹部、皮肤和软组织、骨和关节、女性生殖道、中枢神经系统和下呼吸道感染以及炎症性肠道感染疾病、心内膜炎、菌血症和败血症

脆弱拟杆菌也通常定植于各种哺乳动物的下胃肠道粘膜表面,包括人类、新生羔羊、牛犊、幼兔和小猪。据报道,这种细菌物种可以代谢饮食宿主来源的多糖作为碳和能量来源,并且能够耐受氧气暴露

人类脆弱拟杆菌生态位具有物种特异性,使得单一菌株能够占据主导地位并经历适应性多样化。根据合成和分泌脆弱拟杆菌毒素(BFT)的能力分为产肠毒素脆弱拟杆菌(ETBF)和不产肠毒素脆弱拟杆菌(NTBF)。 ETBF 已被确定为临床感染中常见的机会致病菌,可促进慢性炎,从而导致结肠炎阿尔兹海默症甚至是结直肠癌

★ 脆弱拟杆菌的危害

从人类中分离出的脆弱拟杆菌菌株中有10%至20%编码脆弱拟杆菌毒素(BFT),这是一种锌依赖性金属蛋白酶,可通过E-钙粘蛋白裂解损害结肠上皮屏障。BFT是脆弱拟杆菌研究最多的毒力因子之一,目前的证据表明这种毒素可能是慢性结肠炎结直肠癌的驱动因素。

含毒素菌株或产肠毒素脆弱拟杆菌(ETBF)还会引起儿童和成人的急性和慢性肠道疾病。BFT通过诱导小带粘附蛋白E-钙粘蛋白裂解并启动以炎症和c-Myc依赖性促癌过度增殖为特征的细胞信号传导反应来损害结肠上皮屏障。因此,携带易患结肠炎症或肿瘤形成的基因突变的宿主特别容易受到毒素介导的损伤。最近在具有结肠癌易感位点的人类结肠活检中观察到带有ETBF的生物膜,强烈表明ETBF是结直肠癌的驱动因素。

★ 脆弱拟杆菌的益处

尽管与疾病存在关联,但大约20%的人群似乎是无症状的ETBF携带者不产肠毒素脆弱拟杆菌(NTBF)对结肠上皮细胞有有益作用增强屏障作用,降低膜通透性,抑制其他病原菌定植,优先占据结肠生态位,维持肠道菌群稳态

此外,脆弱拟杆菌具有多种代谢潜力,与多糖利用相关的各种基因通过调节肠道微生物群的组成和促进肠道内短链脂肪酸的产生来影响宿主生理机能。

脆弱拟杆菌的功效很大一部分是由于荚膜多糖的合成。据报道,脆弱拟杆菌可产生八种荚膜多糖,考虑到大多数细菌只能合成一种荚膜多糖(如果它们能合成的话),这是一个惊人的数字 。脆弱拟杆菌荚膜多糖A(PSA)由于其免疫调节功能被广泛描述,这种共生细菌产生由抗原呈递细胞处理的独特荚膜多糖,并激活CD4+ T细胞调节炎症细胞因子的平衡。

脆弱拟杆菌/多糖A已被证明可以减少脓肿、细菌感染,预防结肠炎、结直肠癌、改善中枢神经系统疾病、肺部炎症等

Sun F,et al.Food Res Int.2019

★ 脆弱拟杆菌耐药性很强

多项研究进一步揭示,与胃肠道中的其他厌氧菌相比,脆弱拟杆菌表现出最高的抗生素耐药性最多的抗生素耐药机制。这不仅使得治疗脆弱拟杆菌引起的感染变得困难,而且有可能成为抗生素抗性基因的储存库,导致它们通过整合转座子、整合遗传元件转移到其他正常细菌菌群中。

甲硝唑只是针对所有脆弱拟杆菌分离株的体外活性最强的药物,应被视为经验性治疗脆弱拟杆菌感染的一线抗生素。但是持续监测不同地理区域脆弱拟杆菌的抗生素耐药性模式对于提供合适的治疗方案和更准确地预防感染至关重要。

人们对脆弱拟杆菌的研究不仅要关注其对肠道健康的积极影响,还应关注其潜在的病原性。了解脆弱拟杆菌的特性对于未来的人群的健康至关重要。

脆弱拟杆菌在肠道的定植和竞争

脆弱拟杆菌(B. fragilis)普遍存在于人体内,但随着越来越多的研究和对人体样本的测序,我们发现脆弱拟杆菌不同人群中存在很大的差异(丰度、菌种组成)。

Sun F,et al.Food Res Int.2019

究竟是什么造成了如此显著的差异,主要总结为:宿主因素菌群自身的特殊结构以及细菌间的竞争机制


影响脆弱拟杆菌定植的宿主因素

研究发现,多种因素,包括饮食身体状况药物摄入生活习惯,都会影响肠道中脆弱拟杆菌的丰度

★ 饮食对脆弱拟杆菌的丰度有重要影响

其中,饮食对脆弱拟杆菌肠道丰度的影响最大。对蒙古人群饮食干预的研究表明,从含有高水平蛋白质和脂肪的传统饮食转向富含碳水化合物的饮食导致脆弱拟杆菌丰度发生显著变化

在泰国,对来自两个饮食偏好不同地区的60名健康儿童的肠道微生物群落进行分析发现,来自肉类和碳水化合物占饮食比例较高地区的儿童中脆弱拟杆菌的丰度较高

此外,在六名患有2型糖尿病或高血压的肥胖受试者中,严格的素食饮食被证明可以增加共生微生物的丰度,例如脆弱拟杆菌。另一项对913名婴儿(1个月)进行的研究显示,母体补充维生素D和婴儿直接补充维生素D与脆弱拟杆菌丰度正相关

★ 不同年龄的人脆弱拟杆菌存在差异

不同年龄段的人肠道中脆弱拟杆菌存在差异。脆弱拟杆菌在宿主体内的丰度在出生时会丰富弱的粘膜选择性使得多种脆弱拟杆菌菌株能够在婴儿宿主体内共存。

脆弱拟杆菌的持久性在4个月至1-2岁之间增加,这与适应性免疫系统的发育相对应。随着人类肠道微生物群的成熟,脆弱拟杆菌的特定菌株更有可能在肠道定殖。研究表明,随着时间的推移(即数十年),拟杆菌门的成员在宿主肠道内构成最稳定的细菌成分,并且单一菌株通常在该物种中占主导地位。

★ 生活方式和健康状态影响脆弱拟杆菌丰度

与健康人相比,患有真菌性角膜炎急性阑尾炎炎症性肠病家族性腺瘤性息肉病结直肠癌等疾病的患者肠道细菌微生物组中脆弱拟杆菌丰度通常会增加

此外,同一疾病中不同年龄段患者的脆弱拟杆菌丰度也不同,儿童脊柱关节炎患者的脆弱拟杆菌丰度增加,而成人患者则出现相反的现象。

对短期二甲双胍治疗后从2型糖尿病患者收集的粪便样本进行的分析显示,脆弱拟杆菌的丰度有所减少。然而,抗结核治疗导致脆弱拟杆菌的丰度显著增加

腹泻患者产肠毒素脆弱拟杆菌感染率较高

已在健康个体腹泻患者的粪便样本中鉴定出产肠毒素脆弱拟杆菌(ETBF)。注意,腹泻患者中ETBF的患病率(20-30%)大约是健康个体(10-20%)的两倍

来自不同城市和地理位置的报告显示,1岁以上腹泻儿童的ETBF定植百分比高于年龄匹配的对照组

有趣的是,一岁以下的儿童,患病率在一般人群中最低,并且与腹泻无关,这表明发育轨迹对于腹泻相关性的发生很重要。

肥胖人群的脆弱拟杆菌丰度较高

宿主的生活方式生理状态也会影响肠道脆弱拟杆菌的丰度。例如,缺乏运动可能会导致脆弱拟杆菌和其他拟杆菌属物种显著富集

以往的研究表明,脆弱拟杆菌与肥胖呈正相关,肥胖儿童中脆弱拟杆菌的丰度高于瘦儿童。

★ 抗生素和药物的使用减少脆弱拟杆菌

抗生素可以显著改变肠道微生物群的组成,可能导致脆弱拟杆菌数量减少。除了抗生素,其他药物如抗酸药非甾体抗炎药等也会对脆弱拟杆菌的丰度产生影响。

此外,宿主的遗传背景不同地理位置也可能影响肠道中脆弱拟杆菌的丰度和组成

★ 一部分以毒性依赖的方式定植

由于不产毒素脆弱拟杆菌(NTBF)很容易在人类结肠中定殖,并且在小鼠模型中进行的研究表明其有利于宿主T细胞反应的发展

一种特定的 ETBF 菌株(43859)可以以毒素依赖性方式定植先前被NTBF(TM4000) 占据的生态位。然而,毒素的存在并不是腔内生态位获取或竞争的普遍决定因素,这也部分依赖于脆弱拟杆菌VI型分泌系统(T6SS)和其他遗传决定因素。

中毒促进ETBF的传播。如前所述,在1至5岁儿童中,腹泻患者的ETBF计数会增加。毒素的产生和相关的腹泻可能是病原体通过增加粪口污染在人与人之间传播的关键策略

霍乱弧菌肠沙门氏菌等人类肠道病原体利用腹泻作为在人类宿主之间传播感染的手段,因此产肠毒素脆弱拟杆菌也可能属于这种情况。


脆弱拟杆菌定植人体会有哪些危害?

• 造成多组织感染甚至菌血症

适量的脆弱拟杆菌定植于肠道可能不会引起任何症状,然而,脆弱拟杆菌表现出侵入体内多个组织部位的能力。当这种细菌逃离肠道并进入血液或其他组织时,可能造成感染甚至菌血症

如果脆弱拟杆菌逃逸到腹腔血液或其他无菌环境,它可能导致感染,如腹膜炎、菌血症、败血症、脑膜炎、肺炎、皮肤和软组织感染等。

脆弱拟杆菌毒素(BFT)已被证明对肺上皮细胞以及内皮细胞具有体外毒性,表明其在肠外感染中具有潜在作用 。尽管定植的其他遗传决定因素(包括荚膜多糖)与肠外感染脓肿形成有关,但BFT的这种作用尚未明确定义。

ETBF 在血流分离株和阴道感染样本中可能更具代表性 。

• 与慢性肠道疾病存在关联

产肠毒素脆弱拟杆菌(ETBF)与慢性肠道疾病的关联已经建立了二十多年,首次报道是在炎症性肠病患者中。ETBF还与溃疡性结肠炎结肠肿瘤呈正相关。

结直肠癌患者中ETBF的相关性包括散发病例和家族病例,表明这种疾病无论何时起病,都具有生理学共性。人群中ETBF的高无症状携带率与 ETBF 相关炎症性肠病散发性结直肠癌病例数低之间的差异表明,致病性不是随机的,而是取决于未知的宿主易感性决定因素

• 造成抗生素耐药性

脆弱拟杆菌是已知的可以携带抗生素耐药基因的细菌,这使得感染难以治疗,并且可能导致耐药性在细菌之间传播

拓展:脆弱拟杆菌毒素的发现

1984年首次报道了脆弱拟杆菌的肠道毒性,描述了羔羊腹泻。当时,产肠毒素菌株和非产肠毒素菌株之间存在明显区别,但腹泻的病因尚不清楚

1992年,首次证明肠毒素菌株培养物上清液中的一种成分导致了先前在向羔羊回肠环(LIL)注射细菌时观察到的分泌表型。开发了一种使用结肠癌HT29细胞系进行脆弱拟杆菌毒素(BFT)细胞损伤的体外测定方法,允许同时筛选多种产肠毒素菌株。该毒素最初从培养物上清液中纯化为20-KDa蛋白质,并在LIL和HT29模型中分别具有肠毒性和细胞毒性。

该毒素的部分克隆和表达表明它是一种不耐热的金属蛋白酶。还开发了用于检测毒素的诊断方法,从而可以确认患有ETBF相关腹泻的人中分离出的ETBF菌株中存在肠毒素

克隆了BFT基因的完整序列,氨基酸序列的表征和生化分析表明,BFT是作为原毒素产生的,经过处理后将活性C末端结构域释放到细胞外环境中 。进一步的研究表明,原毒素的裂解不依赖于金属蛋白酶结构域的锌结合基序,并且整个C末端结构域对于毒素活性至关重要。

详细的结构分析确定,N端前结构域可能参与原毒素通过细胞被膜的分泌以及细菌细胞内毒素活性的抑制。有趣的是,N端结构域包含代表独特折叠的脂蛋白信号肽,而C端金属蛋白酶结构域是真核A解整合素和金属蛋白酶(ADAM)蛋白酶的异种同源物,表明脆弱拟杆菌水平获取BFT。

如下图所示,原毒素的裂解可通过来自肠腔的宿主蛋白酶在体内发生。有趣的是,在血液中,BFT只能被单一的内源性细菌半胱氨酸蛋白酶激活命名为fragipain (Fpn) 。当静脉注射细菌时, ETBF fpn突变菌株无法导致小鼠死亡,这表明 Fpn 在 ETBF 介导的脓毒症中的重要性。fpn基因存在于大多数 NTBF 和 ETBF 菌株中,表明 Fpn 除了 BFT 激活之外还有其他作用

控制脆弱拟杆菌毒素分泌的已知分子机制

Valguarnera E,et al.J Mol Biol.2020


毒素-宿主的相互作用

自从发现脆弱拟杆菌毒素(BFT)以来,控制宿主细胞损伤的分子机制已经被描述。当建立HT29细胞模型(结肠癌HT29细胞)时,观察到BFT引起细胞变圆和脱落,推测是由于细胞间连接损伤所致

经BFT处理的HT29细胞的形态变化被发现是F-和 G-肌动蛋白重排的产物。BFT以蛋白酶依赖性方式与未识别的细胞受体结合,并诱导小带粘附蛋白E-钙粘蛋白的胞外结构域裂解;这种裂解事件仅发生在完整细胞的情况下。

鉴于BFT与ADAM10的相似性,BFT可能直接促进E-钙粘蛋白裂解。由于尚无证据表明BFT可以直接处理细胞E-钙粘蛋白,因此另一种假设是,BFT对其受体或另一种宿主蛋白的活性可能触发导致E-钙粘蛋白丢失的信号传导途径(下图)。

脆弱拟杆菌毒素-宿主细胞相互作用

Valguarnera E,et al.J Mol Biol.2020

BFT通过未知受体与结肠上皮细胞(CEC)结合,并触发 E-钙粘蛋白的裂解

BFT:脆弱拟杆菌毒素;ETBF:产肠毒素脆弱拟杆菌。

• 增加了白细胞介素-8的分泌

BFT介导的E-钙粘蛋白裂解促进β-连环蛋白迁移至细胞核。此外,BFT对E-钙粘蛋白的切割会触发丝裂原激活蛋白激酶(MAPK)和NF-κB通路的诱导,从而增加白细胞介素-8(一种吸引多形核细胞的趋化因子)的分泌。

NF-κB 激活通过诱导 COX2 和增加前列腺素 E2控制肠细胞的液体分泌水平。BFT诱导COX2和血红素加氧酶1 与肠上皮细胞凋亡延迟有关。

• 诱导宿主防御机制,影响疾病进展

BFT还可以诱导宿主防御机制,例如β-防御素2和铁载体结合抗菌蛋白 lipocalin-2 的表达,并且还可以通过 MAPK、AP-1增加人脐静脉内皮细胞的自噬

受毒素影响的信号通路导致HT29细胞中基因表达差异表观遗传变化。当毒素刺激取消时,宿主细胞转录谱和表观遗传标记的变化就会消失,这表明ETBF持续分泌毒素可能是疾病进展的一个组成部分


影响脆弱拟杆菌定植的细菌因素

拟杆菌属的物种在生命早期获得,常见于下胃肠道。给定菌株能否在其生态位中建立成功,有许多潜在的决定因素,包括宿主饮食、发育、抗生素的使用以及与微生物群其他成员的相互作用

尽管外部因素(例如上述因素)对于定植至关重要,但脆弱拟杆菌携带定植的遗传决定因素,通过与宿主和微生物竞争者相互作用,有助于占据生态位

• 荚膜多糖

在20世纪70年代的研究中描述了脆弱拟杆菌的荚膜,认为这是该生物体相对于拟杆菌属其他物种的显著特征。这些观察结果,再加上脆弱拟杆菌是人类厌氧感染中最常见的拟杆菌属,尽管其在微生物组中的相对丰度较低,因此得出了脆弱拟杆菌荚膜与疾病发病机制有关的假设

荚膜多糖利于脆弱拟杆菌在宿主体内生存

事实上,研究表明脆弱拟杆菌减少了免疫细胞的吞噬作用,从而增加了结肠腔外的细菌适应性。与这一发现一致,荚膜多糖是脆弱拟杆菌形成肠外脓肿的主要因素

脆弱拟杆菌(B.fragilis)拥有8个不同的基因组位点,每个基因座都编码合成特定荚膜多糖变体所需的酶。这些基因座的表达是通过启动子倒位为“开”或“关”构型来调节的。

当脆弱拟杆菌经过动物传代时,荚膜多糖水平会增加,表明其在宿主体内的生存中发挥着关键作用。无菌小鼠的单定植实验表明,任何荚膜多糖都足以建立生态位;然而,这一发现并不表明所有荚膜变体在宿主内具有免疫等效性,或者单个荚膜变体足以在复杂的生态系统中定植。

荚膜多糖会影响免疫,使脆弱拟杆菌更耐受

B. fragilis荚膜多糖由两性离子聚糖的重复单元组成。与大多数聚糖抗原不同,多糖A(PSA)可以在MHCII抗原呈递细胞的背景下呈递,诱导调节性T细胞的形成,从而有助于对脆弱拟杆菌的免疫耐受

PSA通过Toll样受体(TLR)2 途径诱导IL-10产生,并抑制无菌小鼠中IL-17的产生,从而促进低炎症环境 。然而,缺乏PSA不会降低不产肠毒素脆弱拟杆菌(NTBF)定植的小鼠中的 IL-10。对于产肠毒素脆弱拟杆菌(ETBF),最近使用人类结肠组织活检的速冻样本进行的研究表明,PSA表达与脆弱拟杆菌毒素基因携带之间呈负相关这表明可能会加剧炎症

总之,这些研究表明可能存在菌株和环境依赖性调节元件来调节宿主对脆弱拟杆菌多糖的反应

• 多糖利用位点

多糖利用位点(PUL)是专门负责复杂聚糖分解和同化的特殊位点;这些构成了一些拟杆菌属物种基因组含量的近20%

加工不同的膳食多糖增加了生存机会

不同的PUL可以加工不同的多糖,使拟杆菌能够加工膳食聚糖和宿主聚糖。营养物质利用的多功能性增加了宿主饮食变化期间的生存机会;因此,拟杆菌属物种内的PUL多样性是生态位获取和稳定生态位占有的关键。

通过基因筛查发现了“共生定植因子”(ccf)操纵子,ccf操纵子的结构类似于拟杆菌属的典型多糖利用位点(PUL)。与大多数PUL类似,ccf操纵子由控制基因表达的转录调节因子sigma/antisigma因子对(ccfA和ccfB)组成。ccfA/B的下游是TonB依赖性受体,它将分解产物转运到细胞周质(ccfC)和SusD样辅助脂蛋白 (ccfD),这是控制ccfC营养转运所需的。

最近的一项研究表明,ccf基因座控制荚膜变异抑制PSA并诱导多糖C(PSC)表达。ccf功能允许响应PSC建立IgA依赖性生态位,使脆弱拟杆菌细胞能够定位到更靠近肠道上皮的位置

• 脆弱拟杆菌溶血素

许多革兰氏阴性和革兰氏阳性细菌分泌裂解红细胞的酶,称为溶血素脆弱拟杆菌也不例外,因为许多菌株携带溶血素直系同源基因。溶血素A和B(分别为HlyA和HlyB)已被证明在体外对红细胞具有酶活性。

缺乏溶血素A和B的脆弱拟杆菌适应性较低

缺乏hlyA/B基因的脆弱拟杆菌突变株在体外和体内表现出适应性降低,表明溶血素可能参与定植。但目前尚无明确证据表明溶血素脆弱拟杆菌引起的疾病发病机制中具有特定作用。

• 神经氨酸酶

细菌糖苷酶无处不在,被许多生物体用来降解复杂的多糖,以达到营养和生态目的。而脆弱拟杆菌和其他拟杆菌属可以通过分泌神经氨酸酶将唾液酸从宿主糖蛋白上裂解下来。

神经氨酸酶有助于脆弱拟杆菌利用更多的营养物质,从而帮助定植

唾液酸通常存在于宿主糖蛋白上。研究最多的来自脆弱拟杆菌的神经氨酸酶是由nanH基因编码的。nanH的缺失会产生突变株。

宿主糖蛋白的唾液酸释放和利用可能作为营养多样性的额外衡量标准,这对肠道共生至关重要。神经氨酸酶似乎还通过释放唾液酸和发现其他聚糖部分来增加脆弱拟杆菌与哺乳动物上皮细胞的结合。nanH基因的存在也被用作附加分类信息的手段,用于对感染部位和粪便样本中分离的脆弱拟杆菌进行分类

• 蛋白酶

脆弱拟杆菌已被证明可产生除脆弱拟杆菌毒素和脆杆蛋白酶以外的其他蛋白酶。在脆弱拟杆菌菌株的基因组中发现了C10家族(BFP)的半胱氨酸蛋白酶子集

蛋白酶有助于适应环境变化

BFP基因表达,特别是BFP4,在体外随着氧气浓度的增加而被诱导,这表明BFP在适应环境变化中具有一定的作用。

BFP基因在感染部位的细菌分离物和健康捐赠者的粪便样本中均被发现;然而,尚未对同基因BFP缺失菌株进行评估,以评估BFP在致病性中的作用。

在脆弱拟杆菌中也发现了一种纤维蛋白原降解蛋白酶,尽管其在毒力中的作用尚不清楚。

• 粘附分子

细菌细胞通过粘附素粘附到基质上,粘附素是特异性结合宿主细胞受体的蛋白质。许多粘附素表达为菌毛或菌毛的一部分。

在拟杆菌等共生肠道细菌中,与肠道粘液和上皮细胞的结合有利于稳定的肠道生态位定植。在人类中,绒毛菌株更常见于脓肿和健康粪便样本,而非绒毛菌株则富含血液感染的分离株。

细胞粘附性丧失会促进肠外传播和免疫逃避

粘附的毛状拟杆菌更容易被中性粒细胞吞噬;因此,细胞粘附性的丧失可以促进肠外传播和免疫逃避

血液分离物中比在脓肿或健康粪便分离物中更频繁地观察到与红细胞的特异性结合或血凝作用。

结合蛋白有助于脆弱拟杆菌在肠外存活

脆弱拟杆菌还呈现细胞外基质(ECM)结合蛋白,表明其在肠外存活中发挥作用。与ECM中最丰富的蛋白质纤连蛋白的结合是由类似于TonB依赖性受体BF1991的蛋白质介导的。

令人惊讶的是,缺乏BF1991的突变菌株比野生型菌株对纤连蛋白的粘附性更强,这表明存在多余的纤连蛋白结合蛋白。BF1991突变体在体外更容易被巨噬细胞吞噬

脆弱拟杆菌与层粘连蛋白-1和胶原蛋白-1的结合也有报道。与其他人类病原体类似,脆弱拟杆菌可以与凝血相关的血浆蛋白相互作用。BF-FBP是一种54-KDa的蛋白质,可结合纤维蛋白原,纤维蛋白原是纤维蛋白脓肿形成的主要成分。

其他蛋白质可以结合纤溶酶原高分子激肽原,但在脆弱拟杆菌操纵宿主凝血过程中的作用尚不清楚。脆弱拟杆菌可能结合的宿主靶标的多样性使我们能够假设体内可能会诱导不同的结合模式作为对环境和宿主线索的反应。

• 氧化应激反应

由于肠腔内的氧气浓度梯度,肠道细菌暴露于宿主外部和肠腔内的氧气。拟杆菌临床分离株比非临床分离株具有更高的耐氧性,表明这种适应在发病机制中发挥着作用

含氧量会影响脆弱拟杆菌的感染率

氧化应激反应(OSR)机制在肠外感染的情况下可能特别具有保护作用,因为肠外感染时组织的含氧量比肠腔的含氧量更高

厌氧/需氧通量可以改变基因表达谱,潜在地改变生物体的致病性及其与腹部和腹膜感染的关联。尽管脆弱拟杆菌可以在低摩尔氧浓度下生长,但暴露于较高浓度的氧气会阻止其生长;因此,需要OSR来避免细胞氧化损伤

注:OSR是通过大量具有不同功能的蛋白质来实现的,包括超氧化物歧化酶、过氧化氢酶、过氧化物酶、铁储存蛋白和硫氧还蛋白。转录因子OxyR负责诱导OSR途径中的许多基因。据报道,另一种转录因子bmoR是OSR的组成部分,可诱导维持细胞内氧化还原状态所需的基因。

• 其他环境刺激,例如胆汁酸

脆弱拟杆菌已被证明对胆汁盐的存在有反应,在体外增加细胞粘附和聚集

没有证据表明拟杆菌属的胆汁盐耐受性是一种致病性状,而不是环境应激反应的一部分。mar系统等转录调节因子介导对抗菌药物和其他环境压力源的耐药性。


细菌间的竞争机制

• 拟杆菌中的T6SS

栖息在肠道中的细菌大量存在,并且在这种环境中争夺稳定位置的情况通常存在有毒蛋白的分泌是一种常见的竞争机制,最近多项研究表明T6SS在拟杆菌生态位建立中的重要性以及更广泛的肠道内细菌间竞争。

六型分泌系统(T6SS)是病原菌中高度保守的蛋白质分泌系统,可分泌效应蛋白作用于真核宿主或其他细菌,从而促进其生存及感染

T6SS类似于反向噬菌体,序列和结构分析表明这些系统之间存在同源性。T6SS通过以接触依赖性方式将效应物(毒素)直接从细菌细胞的细胞质分泌到另一个细胞中来发挥作用。

细菌细胞分泌T6SS效应子时会合成特定的免疫蛋白,从而抵抗姐妹细胞的攻击。每个效应蛋白都包含一个同源免疫蛋白,通常由邻近基因编码。尽管已经表明某些细菌可以利用T6SS将毒素注入真核细胞,但大多数物种使用T6SS作为细菌间杀伤机制

在拟杆菌目的物种中,编码T6SS的基因可以存在于被称为基因组结构(GA)、GA1、GA2和GA3的三种不同遗传排列中。虽然GA1和GA2存在于拟杆菌目的许多物种中,但GA3仅限于脆弱拟杆菌。对脆弱拟杆菌GA3限制的进化解释是,GA1和GA2可以通过遗传元件在细菌细胞之间动员,但GA3不包含这种传播特征。

携带T6SS的脆弱拟杆菌有助于竞争中占据优势

根据人类微生物组的序列分析,存在于高达75%的人群中。携带T6SS的拟杆菌在人类中的高流行表明该基因在结肠生态位建立的竞争中发挥着重要作用。

大多数成年人宿主都被单一脆弱拟杆菌菌株定殖;T6SS是幼儿期初始利基获得的关键特征。同一项研究表明,携带T6SS的脆弱拟杆菌与同一生态系统中其他拟杆菌属的增加之间存在关联,这表明GA3效应子-免疫对在体内主要用于脆弱拟杆菌菌株之间的竞争。这可能是由于其他拟杆菌属物种在结肠内占据不同的地理位,限制了脆弱拟杆菌的T6SS的负面影响

 拟杆菌中的抗菌蛋白

除了接触依赖性杀伤作用外,拟杆菌还能分泌可溶性毒素。拟杆菌基因组携带编码毒素的基因,这些毒素属于拟杆菌目分泌的抗菌蛋白(BSAP)

抗菌蛋白对于体内外菌株竞争非常重要

BSAP是含有膜攻击复合物/穿孔素(MACPF)结构域的蛋白质的直系同源物,已被证明对于拟杆菌属物种之间的体外和体内菌株竞争非常重要。

• 拟杆菌分泌的类泛素蛋白

拟杆菌属物种还可以分泌一种类泛素蛋白,介导细菌间杀伤作用。用于细菌竞争的各种各样的接触依赖性和非接触依赖性机制和效应分子强化了这样的概念:单一遗传决定因素不足以在给定生态位中击败许多不同的生物体;多种遗传因素可能控制脆弱拟杆菌占据的生态位。

因此,菌株之间的基因组多样性降低了单一菌株用作通用益生菌以取代肠道生态系统中的ETBF的可能性。目前来看,基因功能的管理仍然是理解脆弱拟杆菌基因组15-20%菌株特异性部分在定植中的作用的主要瓶颈之一。

不产肠毒素脆弱拟杆菌(NTBF)的健康益处

当我们说脆弱拟杆菌是条件致病菌时,意思是在正常情况下,它可能是无害的,但在特定条件下(如免疫力低下),它可以引起疾病。这种菌在特定的环境或宿主状态下,具有潜在的致病能力。而在一般情况下,其可能有一定的健康益处

迄今为止,共生不产肠毒素脆弱拟杆菌(NTBF)菌株已被证明可以抑制不同器官的炎症,包括腹膜、肠道、大脑和肺。这些菌株还可以抑制病原菌感染支持癌症治疗

多糖A(PSA)已被确定为脆弱拟杆菌NCTC 9343产生的主要功能分子。这种多糖具有由重复寡糖单元组成的两性离子结构,该重复寡糖单元包含具有游离氨基和羧基的组成糖,并且对于菌株的有利生物活性至关重要。

此外,脆弱拟杆菌产生的两性离子PSA已被确定为一种免疫调节分子,在免疫系统成熟中发挥作用。T 辅助细胞1(TH1)和TH2细胞是效应CD4+ T细胞群的亚型。在之前的一项研究中,脆弱拟杆菌NCTC 9343或多糖A(PSA)都可以纠正无菌小鼠中的TH1/TH2细胞失衡并增强调节性T细胞(Treg)功能。

最近的研究揭示了脆弱拟杆菌NCTC 9343以及相关PSA在不同疾病中使用的免疫调节机制。新发现的菌株B. fragilis ZY-312 也已被证实对宿主发挥有益的免疫调节作用

此外,源自涉及碳水化合物发酵(包括脆弱拟杆菌)的肠道微生物群的短链脂肪酸,例如主要是乙酸盐、丙酸盐和丁酸盐,具有有益的功能,包括为结肠粘膜提供能量和维持结肠稳态

例如,口服脆弱拟杆菌可以显著增加沙门氏菌感染大鼠肠道内容物中的短链脂肪酸浓度,这可能会进一步减少炎症恢复肠道屏障的完整性

脆弱拟杆菌的免疫调节作用

Sun F,et al.Food Res Int.2019


防止脓肿

经过二十年的研究,脆弱拟杆菌荚膜多糖免疫调节特性已被阐明。研究表明,皮下注射脆弱拟杆菌NCTC 9343 (ATCC 25285) 和 ATCC 23745 荚膜复合物(包含多糖A和多糖B(PSB)),可以防止脓毒症形成的腹腔内脓肿

尽管这种保护活性可能不符合抗原特异性的传统标准,但它可能专门针对多糖上带相反电荷基团的基序。因此,观察到的保护将是T细胞依赖性的

• 通过介导T细胞产生细胞因子减轻脓肿

随后的研究还表明,脆弱拟杆菌产生的两性离子多糖介导CD4 + T细胞反应。观察到的反应需要抗原呈递细胞(APC)内化PSA,然后抗原呈递细胞将 PSA 抗原呈递到主要组织相容性复合物(MHC)II类分子上 。CD4+ T 细胞通过产生白细胞介素-2干扰素-γ和IL-10等细胞因子,进一步提供针对病原菌引起的脓肿的保护

特别地,IL-2被鉴定为脓肿形成的重要抑制剂

下面还将讲述其他研究报道了脆弱拟杆菌相关疾病与具体免疫机制的关联,包括脆弱拟杆菌NCTC 9343 PSA免疫调节机制的典型例子。


对结肠炎的治疗

对小鼠的研究表明,脆弱拟杆菌(B.fragilis NCTC 9343)释放的多糖A(PSA)对结肠炎的治疗具有显著影响,并且可以防止体重减轻和炎症

• 多糖A具有抗炎作用,并有效抑制促炎细胞因子产生

作为一种有用的抗炎分子,PSA被证明可以通过扩大产生IL-10的CD4+CD45Blow T细胞的数量和抑制促炎性IL-17的产生来介导健康的免疫反应并预防小鼠中肝螺杆菌诱导的结肠炎。

在无菌小鼠中,脆弱拟杆菌定殖需要TLR2信号来诱导CD4+Foxp3+T调节细胞的发育,并通过产生IL-10来增强炎症抑制能力。值得注意的是,PSA在动物模型中不仅可以预防结肠炎,还可以治愈结肠炎

外膜囊泡(OMV)中包装的PSA可改善动物结肠炎,类似于口服纯化PSA的效果。此外,最近的一项研究证明了一种相互作用机制,其中脆弱拟杆菌OMV 可以激活非典型宿主自噬途径,从而预防 2,4-二硝基苯磺酸 (DNBS) 诱导的结肠炎。该机制同时需要宿主炎症性肠病相关基因ATG16L1和NOD2的表达。

• 脆弱拟杆菌对适应性免疫与先天免疫都有益

ZY-312 是一种从健康婴儿粪便中分离出来的新型非肠毒素脆弱拟杆菌菌株,最近被证实是拟杆菌门的潜在下一代益生菌候选者。研究报告称,除了对适应性免疫的影响外,脆弱拟杆菌还与先天免疫系统有关。B. fragilis ZY-312 可增强巨噬细胞的吞噬活性并诱导极化至M1表型。

• B.fragilis ZY-312 未来可能成为重要益生菌

进一步的研究表明,B. fragilis ZY-312 可以缓解抗生素相关性腹泻(AAD)大鼠模型中的腹泻并增加微生物丰度。所有这些作用都促进了肠道屏障的恢复和肠上皮细胞的再生,这些机制可能解释了 AAD 治疗的策略。

脆弱拟杆菌产生的短链脂肪酸还可以增加结肠 Tregs 的数量并预防结肠炎。一项体外研究还表明,源自脆弱拟杆菌的短链脂肪酸可以抑制可能导致患者腹泻的产气荚膜梭菌的孢子形成。


改善中枢神经系统疾病

据报道,脆弱拟杆菌对宿主具有间接影响,这归因于其独特的免疫调节功能。脆弱拟杆菌分泌的多糖A(PSA)是中枢神经系统脱髓鞘疾病的有效调节剂和抑制剂

• 预防和改善抗生素引起的肠道细菌变化

在一项实验性自身免疫性脑脊髓炎(EAE)小鼠模型研究中,纯化的脆弱拟杆菌PSA被证明可以预防和治疗口服抗生素治疗引起的肠道细菌变化和疾病发展。人们发现这种保护机制依赖于IL-10的产生。

进一步研究表明,脆弱拟杆菌PSA可能通过TLR2介导的CD39信号传导预防 EAE,并且CD4+细胞上 CD39 的表达可能与分泌IL-17的Th17和分泌IL-10的Tregs之间的平衡有关。

• 改善神经发育障碍和胃肠道异常

上述发现表明肠粘膜组织大脑脊髓之间存在复杂的相互作用。与此同时,在怀孕期间腹腔注射 20 mg/kg Poly(I:C) 诱导母体免疫激活 (MIA) 的小鼠后代中也发现了肠道-微生物组-大脑的联系。

这些后代表现出自闭症谱系障碍(ASD)的特征,伴有社交障碍胃肠道屏障缺陷。然而,口服脆弱拟杆菌可以改善这些缺陷后代的神经发育障碍胃肠道异常

脆弱拟杆菌与人体之间相互作用的潜在免疫机制

Sun F,et al.Food Res Int.2019


抑制气道炎症

最近的研究表明,脆弱拟杆菌PSA可以通过诱导 CD4+ T 细胞的扩增和IL-10的产生来预防气道炎症和实验性哮喘。与免疫的系统性本质一致,研究证实PSA激活的效应/记忆T细胞可以与肺组织中的FoxP3 + Tregs协同预防肺部炎症

首先,PSA抗原被内化并呈递在APC表面表达的MHC II类分子上,促进肠道中CD4+ T细胞的激活。接下来,效应T细胞与肺部常驻FoxP3 + Tregs之间的通讯会增强Tr1细胞的抑制能力,最终导致抗炎细胞因子IL-10的释放并预防肺部炎症

如上所述,脆弱拟杆菌的荚膜多糖通过依赖于CD4+ T细胞激活和随后T细胞驱动的 IL-10 产生的机制抑制气道炎症


减少细菌感染

研究发现,脆弱芽孢杆菌NCTC 9343 可预防多种病原体,包括肝螺杆菌汉氏巴尔通体。最近的一项研究发现,新型脆弱拟杆菌菌株ZY-312分泌的某些物质可以预防副溶血性弧菌感染。另一项研究表明,根据T6SS竞争机制,共生NTBF可以限制致病性ETBF的定植并预防结肠炎

如上所述,BSAP-1是影响微生物群菌株水平组成的重要竞争因子。因此,我们推测脆弱拟杆菌在种间竞争中既使用了已知的竞争机制,也可能与病原体竞争


癌症

B.fragilis NCTC 9343 还有效促进抗癌免疫监视。口服脆弱拟杆菌或多糖可以逆转 CTLA-4 阻断抗癌疗法的无反应性。然而,许多患者不能很好地耐受多种副作用,特别是促炎作用

幸运的是,最近的一项小鼠研究发现脆弱拟杆菌减轻了广泛使用的抗癌免疫抑制剂甲氨蝶呤(MTX)引起的不良反应。PSA 在体外诱导 IL-8 的产生,这可能会抑制结直肠癌细胞的增殖限制上皮间质转化

在体内,脆弱拟杆菌可以预防结肠癌的发展。AOM/DSS 诱导的结肠炎相关结肠癌小鼠模型在施用脆弱拟杆菌后表现出肿瘤发生减少

产肠毒素脆弱拟杆菌(ETBF)与人类疾病的关联

ETBF菌株与多种涉及肠道和肠外感染的病症有关,包括炎症性肠病、菌血症、全身炎症神经系统疾病

Sun F,et al.Food Res Int.2019

然而,无症状ETBF定植在成人中也很常见。事实上,ETBF和NTBF都可以长期定植于人体等宿主,尽管只有前者可以触发致癌的多步炎症反应

在儿童中,ETBF相关腹泻通常发生在1至5岁之间。在成人中,ETBF相关腹泻的发生率可能随着年龄的增长而逐渐增加

一项针对台北市513名肠胃炎患者的研究显示,ETBF感染多发生于老年人寒冷干燥的冬季。此外,ETBF相关腹泻因地理位置而异。

接下来我们重点讲述两种ETBF会引起的疾病。


结肠炎和结直肠癌

结肠炎结直肠癌携带产肠毒素脆弱拟杆菌(ETBF)之间的关联产生了这样的假设:由于其组织损伤性毒素,该菌株是结直肠癌的致病因子

• 感染ETBF可能导致结直肠癌

ETBF可以释放复杂的毒素。一个值得注意的ETBF 毒力因子是脆弱拟杆菌毒素(BFT),一种锌依赖性金属蛋白酶,具有三种不同的分子亚型(BFT-1、-2和-3)。

最近的一项研究表明,BFT可能被fragipain激活。此外,与外膜成分发生疏水和静电相互作用的BFT可能在囊泡形成过程中分泌。

ETBF的暂时扩张会破坏肠粘膜毒素调节系统 RprXY,从而诱发炎症性肠病结直肠癌。ETBF被认为是结直肠癌的危险因素,因为它增加肠上皮细胞的通透性并促进细胞增殖,这与结肠炎和结直肠肿瘤的发生有关。此外,还发现ETBF比例与结直肠癌发生之间存在显著关联

• 感染ETBF会诱导结肠炎的产生

研究表明,口服接种ETBF可以引发肠上皮中细胞间粘附蛋白 E-钙粘蛋白的严重裂解,导致无特定病原体小鼠出现持续性亚临床结肠炎,但在无菌小鼠中迅速导致致命性结肠炎

进一步的报告显示,ETBF产生的BFT可能与假定的结肠上皮受体结合,在γ分泌酶调节的过程中刺激β-肌动蛋白-T细胞因子核信号传导。这种结合会诱导 E-钙粘蛋白的裂解,从而促进原癌蛋白 c-Myc 的表达,并最终促进细胞增殖

此外,在被结肠上皮受体识别后,BFT被证明可以激活 Wnt 和 NF-κB 信号通路,导致 ETBF 诱导的结肠炎小鼠模型中免疫细胞中的Stat3持续激活和粘膜 Th17 免疫反应。

研究发现,家族性腺瘤性息肉病(FAP)患者的结肠粘膜中脆弱拟杆菌毒素基因高度富集。超过一半的FAP患者同时被ETBF和携带基因毒性pks基因岛的大肠杆菌菌株共同定殖,从而产生协同致癌作用

ETBF可以降解粘膜,以促进大肠杆菌pks+E对粘膜组织的再定植。因此,活性氧和IL-17的产生会增加结肠上皮细胞的DNA损伤,导致癌变


阿尔兹海默病

ETBF可能因肠道菌群失调屏障功能障碍而进入血流。最近的研究表明,极度促炎的脆弱拟杆菌脂多糖(BF-LPS)通过胃肠道裂口渗漏到血液中,是导致宿主发生全身炎症的主要因素。BF-LPS还可能穿过血脑屏障,逐渐促进阿尔茨海默病的发展。

• 可能导致促炎性退行性神经疾病的发生

一旦被小胶质细胞上的TLR2、TLR4 CD14识别,BF-LPS可以引发NF-kB 复合物(一种炎症转录因子)以及促炎性 microRNA 的表达。

这些事件抑制 miRNA 结合 mRNA 的表达并触发骨髓/小胶质细胞中的受体,与大脑中散发性阿尔茨海默病的观察结果一致。

因此,我们认为与人类胃肠道微生物组相关的神经毒素,例如 BF-LPS,可能是促炎性退行性神经病理学的驱动因素。


ETBF对肠道健康的影响

除此之外,产肠毒素脆弱拟杆菌(ETBF)对肠道健康具有重要影响。

• ETBF与肠道稳态紧密相关

研究发现,经口灌胃产肠毒素脆弱拟杆菌(ETBF)后,约4周出现结肠疾病。BFT驱动的APC突变小鼠结肠细胞损伤以Stat3和IL-17依赖性方式触发过度增殖反应炎症级联反应

IL-8和其他CXC趋化因子的分泌会招募未成熟的多形核细胞,导致炎症和细胞损伤加剧。这些实验表明,ETBF可以在易患模型生物体中彻底重塑结肠上皮,使其进入疾病状态

最近,来自健康个体和结肠癌患者的粘膜细菌群落被证明可以在三种Apc模型中诱导肿瘤肠道上皮稳态的主要扰动似乎伴随着更严重的产肠毒素脆弱拟杆菌依赖性表型

脆弱拟杆菌毒素对免疫反应的影响

Valguarnera E,et al.J Mol Biol.2020

细胞损伤炎症需要激活β-catenin/Wnt、STAT3 和NF-κβ通路。固有层内的巨噬细胞分泌促炎细胞因子,促进Th17细胞表型。结肠上皮细胞分泌CXC 趋化因子,例如IL-8,促进骨髓细胞募集到损伤部位

• 肠道稳态期间毒素可能被消除

每个个体对结肠炎症生态失调的内在倾向可能决定ETBF是否表现出与无症状定植或严重结肠疾病一致的表型。宿主对ETBF的易感性由哺乳动物宿主细胞本身和共生微生物的状态决定,它们共同形成复杂且动态的生态系统

在肠道稳态期间,毒素的产生可以被消除,或者在具有健康粘液层和共生微生物组的宿主中变得无害肠道环境的扰动可能引发ETBF的致病性,导致炎症和生态失调

调节ETBF共生性或致病性程度的宿主和微生物因素

Valguarnera E,et al.J Mol Biol.2020

由于脆弱拟杆菌毒素(BFT)的分泌和细胞损伤,ETBF携带可能导致结肠疾病的风险,但宿主易感性是ETBF疾病的关键。不允许ETBF定植的健康稳态微生物群落应包含与ETBF竞争结肠生态位的NTBF细菌

NTBF要求胶囊定植并通过T6SS和BSAP建立竞争。

• ETBF感染影响益生菌干预的效果

益生菌干预可能是一种非常有价值的工具,可以延缓易感人群由 ETBF 引起的疾病进展。但最近的研究表明,在小鼠中,将 NTBF和 ETBF联合接种,或在 ETBF 定植后接种 NTBF,并不能挽救慢性结肠炎和结直肠癌的进展

因此,ETBF之前的生态位占据大大降低了益生菌 NTBF菌株定植的成功率。在这项研究中,ETBF 相对于 NTBF 的主导地位部分是由MACPF非 T6SS 毒素的分泌来解释的,这突显了益生菌干预在临床环境中的潜在复杂性,临床环境中遗传多样性很高,而且大多数利基获得决定因素仍未被探索。

拓展:脆弱拟杆菌的耐药性

传统抗生素,如甲硝唑碳青霉烯类药物头孢西丁,通常有效地用于治疗脆弱拟杆菌感染

• 脆弱拟杆菌适应性很强,极易产生耐药性

然而,这种细菌对周围环境的适应性很强,很容易产生抗生素耐药性,抗生素的不当使用进一步助长了耐药性。因此,抗生素耐药性已成为脆弱双歧杆菌感染治疗的主要障碍

这种抗性在很大程度上归因于脆弱拟杆菌的遗传可塑性,即反转、复制、水平基因转移和大规模染色体转移。根据文献,脆弱拟杆菌携带四个CRISPR-Cas系统。其中三个涉及与1类IB型、1类IIIB型和2类IIC型紧密匹配的相邻cas基因。相反,从血液中分离的CRISPR-Cas系统是一个非典型的IIIB型系统,缺乏相邻的Cas基因。此外,脆弱芽孢杆菌的CRISPR-Cas系统可能调节与共生体和病原体转化相关的内源性基因

此外,脆弱拟杆菌具有多药外排泵转运系统,可以将有毒的抗菌底物输出到外部环境,并可能导致对多种抗生素产生耐药性

甲硝唑只是针对所有脆弱拟杆菌分离株体外活性最强的药物,应被视为经验性治疗脆弱拟杆菌感染的一线抗生素。但是持续监测不同地理区域脆弱拟杆菌的抗生素耐药性模式对于提供合适的治疗方案更准确地预防感染至关重要。


下面再分享一些关于脆弱拟杆菌的重要研究

单一脆弱拟杆菌菌株可保护肠道完整性并降低移植物抗宿主病

移植物抗宿主病(GVHD)是一种由供体T细胞引发的促炎综合征,也是同种异体造血细胞移植(allo-HCT)后的主要并发症。

GVHD有两种形式:急性(aGVHD)和慢性(cGVHD)。aGVHD主要由T细胞诱导,通常以1型 T细胞反应为特征,而cGVHD由T细胞和B细胞诱导,具有与自身免疫性疾病相似的表现。

在急性期,GVHD通常针对一组有限的器官,包括皮肤、肺、肝脏和胃肠道。在这些组织部位中,胃肠道在GVHD发病机制中尤为重要,因为肠道损伤在全身GVHD的引发和放大中发挥着关键作用。其结果可归因于粘膜屏障的破坏,这是由于细菌产物(例如内毒素)和驻留在宿主胃肠道中的免疫细胞之间相互作用而导致全身性促炎细胞因子的产生增加。

在临床上,肠道损伤本身和随后的感染并发症可能会危及患者的生命

该研究证明了脆弱拟杆菌可降低急性和慢性移植物抗宿主病。GVHD的降低与诱导的T细胞和B细胞同种异体反应的一些变化有关。脆弱拟杆菌(B.fragilis)通过PSA依赖性方式短链脂肪酸介导的机制稳定肠道环境来调节这些反应。因此,受体肠道完整性得以维持,部分归因于通过IL-22 GRP43实现肠隐窝再生,最终将免疫反应转向减少炎症,从而产生GVHD保护。

这项研究为使用单一菌株(如脆弱拟杆菌)作为安全有效的干预措施提供了强有力的理由和手段,这将有利于临床上的移植患者。

脆弱拟杆菌菌株可增强肠道紧密连接蛋白并表现出肠道抗炎作用

脆弱拟杆菌介导的保护机制很复杂,但来自脆弱拟杆菌的细胞外囊泡及其外膜PSA对 NF-κB 介导的炎症也有效,这种炎症不仅限于结肠疾病

此外,脆弱拟杆菌定植诱导的肠道代谢物(短链脂肪酸)在体内和体外调节免疫细胞发育(Treg)和肠道通透性

研究发现单独使用脆弱拟杆菌处理是无害的,并且对细胞活力或细胞凋亡没有影响。虽然TNF-α可以预见地降低了细胞活力并增加了细胞凋亡,但脆弱拟杆菌却减弱了这种恶化。

TNF-α激活的NF-κB通路以及炎症细胞因子IL-6和IL-1β也被脆弱拟杆菌阻断。值得注意的是,脆弱拟杆菌的代谢上清液还具有抗炎作用

动物研究表明,活体脆弱拟杆菌(而非死亡菌株)可改善 DSS 诱发的结肠炎,体重减轻、结肠长度缩短和屏障功能增强即可证明这一点。

施用脆弱拟杆菌后,结肠组织炎症细胞因子(TNF-α、IL-1β、IL-6)水平降低抗炎细胞因子IL-10水平增加。

总之,脆弱拟杆菌ATCC 25285无论在体内还是体外都表现出抗炎作用,它可能是一种潜在的改善结肠炎的益生菌剂。

脆弱拟杆菌调节宿主对病毒感染和治疗的反应

脆弱拟杆菌及其荚膜多糖A调节 I 型干扰素的组成水平以预防病毒感染

I型干扰素 (IFN-Is) 是一类专门的细胞因子,可协调宿主对病毒的免疫反应。IFN-Is 调节宿主机制,最终杀死受感染的细胞以限制病毒传播。然而,它们还参与免疫细胞的增殖和激活,这对于控制其他细胞内感染、抗肿瘤和抗炎反应至关重要。

哺乳动物中最明确的IFN-Is是干扰素-α干扰素-β。先前的文献表明,肠道微生物群的耗竭降低了肠道和脾脏干扰素刺激的表达基因(ISG)。

在这项研究中,单独给无菌小鼠灌胃脆弱拟杆菌可增加IFN-β基因的表达。正如预期的那样,来自脆弱拟杆菌的多糖A还显著增加了ISG的体外和体内表达以及 IFN-β的分泌。

PSA/脆弱拟杆菌的免疫保护机制

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脆弱拟杆菌多糖A的双重性——炎症特性

事实上,来自脆弱拟杆菌的PSA因其细胞因子诱导特性而被广泛研究,并被证明可以协调炎症过程的抑制,以预防实验性自身免疫性疾病(EAE) 、炎症性肠病等疾病。相反,来自脆弱拟杆菌的PSA也可以促进炎症作用,从而诱发例如脓肿

在最近的一项研究中,描述了PSA反应的这种双重性。在这里,来自脆弱拟杆菌的PSA上调了许多干扰素相关基因的表达,并诱导肿瘤坏死因子-α (TNF-α)、IL-6、IFN-γ和趋化因子配体(CXCL)-10 的分泌。

肠道脆弱拟杆菌可改善肾纤维化

大约10%的普通人群患有慢性肾病(CKD)。肾纤维化不可避免地导致CKD进展,其特征是成纤维细胞和肌成纤维细胞的增殖。肌成纤维细胞的特点是产生α-平滑肌肌动蛋白(α-SMA)纤维、胶原蛋白和细胞外基质(ECM)蛋白。

持续的ECM产生会导致肾小球滤过率降低肾损伤。完全停止疾病进展或诱导肾纤维化消退可以缓解CKD。肾纤维化是进行性慢性肾脏病(CKD)各种表现的必然结果。因此,对针对肾纤维化的有效治疗方案的需求怎么强调都不为过。在这篇研究里,展示了脆弱拟杆菌(B.fragilis)对小鼠肾纤维化的保护作用

脆弱拟杆菌通过降低脂多糖水平来减轻肾纤维化。由于血液中1,5-脱水葡萄糖醇 (1,5-AG) 水平增加,它还能抑制Nrf2/Keap1和TGF-β/Smad信号通路。发现 1,5-AG 是钠-葡萄糖协同转运蛋白 2 (SGLT2) 的底物。B. fragilis恢复了 UUO 和腺嘌呤模型肾脏中 SGLT2 表达的降低。因此,调节肠道中脆弱拟杆菌的丰度可能是治疗慢性肾病的一种策略

脆弱拟杆菌通过代谢调节参与甲氨蝶呤对关节炎的治疗作用

甲氨蝶呤(MTX)是治疗类风湿性关节炎(RA)的首选缓解病情抗风湿药物。然而,MTX的毒性低效限制了其临床应用。肠道微生物群与MTX的副作用和功效有关。

脆弱拟杆菌有助于提高甲氨蝶呤对类风湿性关节炎的疗效

在这项研究中,对RA患者肠道微生物群的分析表明,MTX治疗后肠道脆弱拟杆菌的丰度有所降低。还观察到,在没有脆弱拟杆菌的情况下,MTX没有明显的治疗作用,而脆弱拟杆菌的移植在抗生素预处理的胶原诱导性关节炎(CIA)小鼠中恢复了MTX的功效

此外,强饲脆弱拟杆菌还伴随着丁酸盐的增加。补充丁酸盐可以恢复肠道微生物群缺陷小鼠对 MTX 的反应,达到与脆弱拟杆菌灌胃相似的水平。这些结果表明,肠道微生物群调节的丁酸盐在甲氨蝶呤的疗效中发挥着重要作用,这将为提高甲氨蝶呤在类风湿性关节炎治疗中的有效性提供新的策略。

脆弱拟杆菌衍生代谢物可降低沙门氏菌的毒力

大量研究表明,肠道微生物群含有分泌代谢物的健康细菌,有助于对抗肠道和其他器官的疾病。肠道微生物群产生的代谢物包括叶酸、吲哚、γ-氨基丁酸、血清素、次级胆汁酸、脱氨基酪氨酸短链脂肪酸

多项研究表明,这些存在于无细胞上清液中的微生物群衍生代谢物可能成为对抗大肠杆菌沙门氏菌等病原体的抗生素的替代品。

在这项研究中,在接受脆弱拟杆菌和沙门氏菌生物活性组分的小鼠中,与单独接受沙门氏菌相比,结肠中 cldn-1和occludin的表达显著增加,表明肠道屏障得到改善。在单独存在生物活性组分的情况下,仅cldn-1被上调。

已有报道称,脆弱拟杆菌NTBF ZY-312 会诱导患有抗生素相关性腹泻(AAD)的小鼠中occludin过度表达。B. fragilis NTCC 9343增加了结肠中紧密连接蛋白ZO-1、occludin和claudin-1的表达,以对抗 DSS 诱导的溃疡性结肠炎,而B. fragilis菌株FJSWX11BF没有起到保护作用。然而,在这两项研究中,由于仅使用活细菌,因此并未鉴定出与该调节有关的细菌化合物。

然而,这项研究有一些局限性。实验是在实验室条件下进行的,这并不能完全反映人类肠道的复杂性以及共生细菌可能发挥其有益作用的环境。此外,需要对含有 20%血清的完整 DMEM 进行更多研究,以了解脆弱拟杆菌影响的具体机制

总结

脆弱拟杆菌(Bacteroides fragilis)是人类肠道中的一种共生菌,对于健康有着重要的影响。以前经常将脆弱拟杆菌认为是一种条件致病菌,然而,越来越多的研究发现其有作为益生菌的潜力

脆弱拟杆菌菌株可分为两种亚型:不产毒脆弱拟杆菌(NTBF)菌株,不携带或分泌脆弱拟杆菌毒素 (BFT),以及产肠毒素脆弱拟杆菌(ETBF)菌株,携带BFT基因并编码脆弱拟杆菌毒素

ETBF菌株具有致病性,可能诱发能量代谢功能障碍影响肠道稳态,产生的毒素能导致结肠炎阿尔兹海默病甚至是结直肠癌

相比之下,NTBF菌株通常被认为是有益的共生微生物,可能通过种间竞争对抗ETBF。它还参与调节免疫系统保护肠道屏障以及代谢关键营养物质。这些有益菌株通过释放某些有利分子来促进肠道健康,其中一种已被明确鉴定为多糖A

通过深入理解脆弱拟杆菌与宿主之间的微妙平衡,我们可以更好地利用这种微生物来促进人类健康,并开发新的治疗策略来对抗相关疾病。

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肺炎克雷伯菌

谷禾健康

肺炎克雷伯菌(Klebsiella pneumoniae),也称弗里德兰氏杆菌,最早是由德国微生物学家和病理学家Edwin Klebs卡尔·弗里德兰德于1882年描述的。

01 肺炎克雷伯菌简介

肺炎克雷伯菌是一种革兰氏阴性不运动的,包囊的杆状芽孢杆菌,存在于人类和非人类灵长类动物的鼻咽和胃肠道中。属于克雷伯氏菌属和肠杆菌科。兼性厌氧的,氧化酶为阴性,并从乳糖产生酸和气体。它是一种肠内细菌,在5%的健康人的肠道中可见。也可以驻留在皮肤和口腔中。

肺炎克雷伯菌可以自然存在于健康个体的肠道和呼吸道中,具有健康免疫系统的人很少发生感染疾病。

肺炎克雷伯菌的扫描电镜观察 

图源:Janice Carr/Centers for Disease Control and Prevention (CDC)

肺炎克雷伯氏菌在人宿主中有两个主要的定植渠道:上呼吸道和肠道。肺炎克雷伯菌建立定植必须与这两个位置的微生物群和免疫系统建立的防御系统抗衡

表达多种致病性因子,包括多种粘附素,荚膜多糖,铁载体和脂多糖,可逃避宿主防御。例如,荚膜多糖(K抗原)可防止吞噬作用;染色体上携带的多种抗生素抗性基因等。

科学分类

  • 界: 细菌界 Bacteria    
  • 门: 变形菌门 Proteobacteria    
  • 纲:  γ-变形菌纲 Gammaproteobacteria    
  • 目:  肠杆菌目 Enterobacterales    
  • 科:  肠杆菌科 Enterobacteriaceae    
  • 属:  克雷伯氏菌属 Klebsiella

Trevisan 1885 emend. Drancourt et al. 2001    

02 肺炎克雷伯菌的人群分布

首先我们先来看看,肺炎克雷伯菌这种菌在人群中的分布情况究竟是怎样的?

我们从谷禾健康2019年近期检测人群肠道菌群样本抽取1.3万例样本,人群共计13358人,涵盖0~103岁人群。

其中肺炎克雷伯氏菌丰度占比超过1%的人群有3765例,占比28.2%。

谷禾健康肠道菌群数据库

肺炎克雷伯菌可以逃避人体的正常保护机制。除了攻击肺和膀胱等器官外,它还引发炎症反应,从而加剧发烧和发冷等症状。

接下来我们详细了解一下,克雷伯菌感染后会有哪些症状。

03 克雷伯菌感染的症状

在新的和旧的灵长类动物中,这种细菌都与脑膜炎,腹膜炎,败血病和肺炎有关。肺炎克雷伯菌是引起肺炎的人类呼吸系统的主要病原体之一。

当细菌直接进入人体内时,通常会发生克雷伯菌感染。一旦它们进入体内并在免疫系统的防御中幸存下来,它们就会影响各种器官。疾病的症状通常取决于感染开始的位置

感染包括泌尿道、血液、脑部等。克雷伯菌的感染迹象和症状会随感染部位的不同而不同

肺部感染

这类肺炎的主要症状是发烧和发冷,由于咳嗽,可能还会感到胸部不适,呼吸急促,疲倦。如果疾病已经蔓延很多,那么可能还会遇到一些其他症状,例如咳嗽时痰液浓稠,带血,通常被称为“黑加仑果冻痰”

像肺炎球菌一样,克雷伯菌属感染肺部一般会产生大叶性肺炎有黏液状的“粘液样”外观,并且上叶的原因不明。感染会导致血性坏死,微脓肿和空腔形成。部分克雷伯菌属还会产生慢性坏死性肺炎,并伴有疤痕和肺部解剖结构扭曲。

鼻部感染

感染克雷伯氏菌会导致鼻粘膜的恶臭消散(萎缩)。

克雷伯氏菌鼻硬膜炎可引起鼻硬化症,是鼻子和喉咙的破坏性结节性炎症

眼部感染

如果肺炎克雷伯菌(K. Pneumonia)感染了血液,那么它有可能会传播到眼睛并引起严重的感染,称为眼内炎。它主要引起眼睛的白色部分发炎

在较早阶段,这种感染会导致眼睛发红和轻度至重度疼痛。除了不适,还可能会从眼睛排出白色或黄色粘液。

当感染处于晚期时,会导致视力模糊和畏光。如果不加以治疗,细菌还会扩散到大脑中,并引起其他健康并发症。

血液感染

当肺炎克雷伯菌进入血液并对其进行感染时,通常会发生细菌血症。症状可能包括发冷,发烧,发抖,肌肉酸痛,疲劳和嗜睡。可能还会出现意识变化。败血症可作为反应发生。

脑膜炎

在某些由肺炎克雷伯菌引起的眼内炎中,微生物从患者的眼睛传播到大脑,并引起细菌性脑膜炎。但是,已知这种肺炎克雷伯菌很罕见,通常发生在老年人中。

当一个人患有这种类型的感染时,他们会突然发高烧,脑膜(大脑周围的保护层)感染可引起头痛,脖子僵硬,背部疼痛,疲劳。由于急性疼痛,许多人也会感到恶心和畏光的感觉。在极少数情况下,脑膜炎会引起癫痫发作。

如果不及时治疗,在某些情况下也可能导致患者死亡。

尿路感染

当肺炎克雷伯氏菌细菌进入人的尿道(包括肾脏,尿道和膀胱)时,会引起严重的尿路感染(UTI)。

起初由克雷伯菌引起的泌尿道感染通常不显示任何明显的体征。但是,随着感染的增加,开始出现许多严重的症状。

这可能会导致尿频排尿灼热感,膀胱急迫和尿失禁。其中,尿频是最常见的一种。它还可能引起发烧、小腹和骨盆区域的疼痛或不适。

这种感染通常发生在使用导尿管一段时间的患者中。通常,它在老年妇女中更为常见。

伤口感染

如果肺炎克雷伯菌通过瘀伤进入,可导致伤口愈合延迟,发红,脓液和疼痛,发烧,疲劳。

那么它也可以感染体或皮肤的软组织。这种类型的感染发生在那些因手术和受伤导致开放性伤口的人中。

可能会感到非常恶心,但是医生不一定能马上知道感染这种菌,肺炎克雷伯菌的感染通常以与其他感染相似的症状为特征。要经过诊断测试才能确认。

化脓性肝脓肿

肺炎克雷伯菌还可以感染肝脏,并在其中引起脓性病变,它被称为化脓性肝脓肿。这种类型的感染更常见于患有糖尿病一段时间或已经服用抗生素多年的人。

患有化脓性肝脓肿的人可能出现

轻度至重度发烧、呕吐(有血或无血)、急性腹泻、经常感到恶心、右上腹部轻度疼痛。

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克雷伯菌亚种及来源

  • K. pneumoniae (肺炎克雷伯菌); 
  • K. granulomatis; 
  • K. mobilis; 
  • K. ornithinolytica;  
  • K. oxytoca; 
  • K. ozaenae; 
  • K. planticola; 
  • K. rhinoscleromatis; 
  • K. singaporensis;  
  • K. terrigena; 
  • K. trevisanii; 
  • K. variicola

克雷伯菌的其他种类包括产酸克雷伯氏菌植物肺炎克雷伯菌与肺炎克雷伯菌一起可引起人尿道和伤口感染。肺炎克雷伯菌的罕见亚种会引起特别严重的疾病。

K. ozaenae

是一种罕见的人类病原体,很少引起严重感染,被认为是萎缩性鼻炎的病因(萎缩性鼻炎:以粘液脓性分泌物、粘膜结痂和恶臭为特征)。K. ozaenae菌血症是一种罕见的临床问题。在文献中,只有十二病例报告。

K. rhinoscleromatis

可导致缓慢进展的疾病,称为鼻硬化症。在首次临床表现时,患者最初可能处于疾病的第一阶段(鼻炎),伴有鼻塞、结痂和恶臭。随着疾病进展到肉芽肿阶段,患者开始出现更明显的鼻塞、畸形、鼻衄、嗅觉障碍。

K.oxytoca

与新生儿菌血症有关,尤其是在早产儿和新生儿重症监护病房中。从新生儿菌血症患者中分离出来。

K. planticola

已从诸如小麦,水稻和玉米(玉米)等植物的根中分离出了K. planticola和某些肺炎克雷伯氏菌菌株,它们在其中起着固氮细菌的作用。

K. variicola

变栖克雷伯菌K. variicola于2004年被发现,它也存在于多种植物中,包括水稻,香蕉和甘蔗。这种细菌还已经从医院环境中分离出来,在医院中它可能像其他克雷伯菌一样,是一种条件致病菌。

Alfred Pasieka/science Photo Library 

05 肺炎克雷伯菌的传播和易感因素

肺炎克雷伯菌通常通过触摸,唾液交换和其他接触方式从一个人传给另一个人。没有被这种细菌感染的人也可以将其传播给另一个人。

它们还可以通过其他一些医疗设备传播,例如输尿管和静脉导管,呼吸机等。但是,肺炎克雷伯菌不能通过空气传播。

克雷伯菌肺炎通常发生在由于年龄,酒精滥用或糖尿病等导致免疫功能低下人群。常出现在酒精中毒或慢性肺部疾病等患者中,并且通常以医院感染的形式出现。

此外,易感因素包括营养不良,接触程度,不卫生的环境和遗传易感性等

具体易感因素如下:

1.开放性伤口

克雷伯氏菌微生物可以通过开放性伤口从一个人传播到另一个人。因此,如果有开放性伤口,那么受到这些感染的风险增加近35%。

2.酒精

酒精除了会使人醉,还会影响人的免疫系统并降低其整体能力。如果一周中的每一天几乎都喝酒,那么免疫系统可能会弱,从而增加感染肺炎克雷伯菌的风险。

3.癌症药物

通常用来治疗癌症的药物会降低人体免疫力。因此,细菌更容易在体内生长并引起感染。

4.服用抗生素

抗生素药物会降低免疫力。如果长期服用抗生素,那么感染克雷伯菌的风险就会大大增加。

5.肾衰竭

如果患有肾脏方面的疾病,那么患克雷伯氏菌感染的风险也较高。肾脏衰竭是又一个可能增加感染克雷伯菌感染的机会的原因。

6.年龄

已知衰老是最主要的因素之一,它会降低我们的免疫系统的能力。因此,肺炎克雷伯菌引起的感染通常在65岁以上的人群中更为普遍。

7.慢性肝病

肝脏有助于清洁血液中的废物成分,从而使免疫系统保持健康有活力。但是,如果一个人患有慢性肝病,肝脏就不能很好地清除血液中的废物。会降低免疫力,更容易感染细菌。

以上原因是较为常见的,当然还有一些其他原因,比如:

长时间使用皮质类固醇;  器官移植;  慢性阻塞性肺疾病;糖尿病;

使用受感染的输尿管导管;  进行重大的手术;  使用被感染的呼吸机。

06 肺炎克雷伯菌的诊断

医生可能进行病史检查,也会使用影像学检查来诊断感染(例如肺炎等),但肺炎克雷伯菌的诊断主要基于实验室检查

通常,由该菌引起的肺炎,脑膜炎,伤口感染和任何其他部位感染会感到恶心。医学评估通常着重于确定感染的原因并寻找并发症的征兆,例如脓肿。

 病 史   

医生会问是否发烧,恶心,咳嗽,呼吸困难,疼痛不适以及睡眠情况。可能还会问与患有类似疾病的人的接触情况。

 体 检   

检查将包括对体温,嗓子,呼吸音的评估,以及对腹部压痛的评估。将检查任何伤口或疼痛的皮肤区域是否发红,肿胀或发热。

影像学检查

这是最常见的检查之一,医生通常会要求患者进行这些检查以定位疾病的位置和传播。假如医生怀疑肝脏有病变,那么他会要求检查。

肺炎克雷伯菌通常会影响右上肺叶,并导致形成空腔以及引起脓液的组织死亡。这些会在胸部X射线上比较明显,这就是成像检查的原因。

根据症状可能还需要对腹部,膀胱,大脑或骨骼进行影像学检查。

诊断测试  

医生可能还需要取样,包括血液,粪便,尿液并进行微生物检测,具体取决于怀疑的感染。

甲痰样品可以检测细菌性肺炎。

检测是否有败血症可能需要血液样本

如果怀疑细菌性脑膜炎可能需要腰椎穿刺

如果伤口被感染,需要对感染区域的一小部分样本进行检测。

如果是腹泻,可能会送检粪便样本

以上样本会被送至实验室进行培养或测序,以便识别传染性细菌(及其对抗生素的敏感性)。

07 肺炎克雷伯菌的治疗及预防

抗生素治疗

如果患者感染了非耐药性肺炎克雷伯菌,通常会用抗生素治疗。可以口服或静脉注射。

医生可能会考虑的抗生素包括:

阿扎坦(aztreonam);

喹诺酮类;

第三或第四代头孢菌素,例如罗芬(头孢曲松);

碳青霉烯类,例如Primaxin(亚胺培南/西司他丁);

青霉素,例如佐辛(哌拉西林-他唑巴坦)

治疗持续时间因抗生素而异,但大致范围可能是2-14天。

此外,一定要告诉医生是否对青霉素过敏,青霉素过敏者无法服用某些抗生素。

# 抗生素耐药性 #       

肺炎克雷伯氏菌是革兰氏阴性杆菌,包裹在厚多糖胶囊中。

某些肺炎克雷伯菌已经进化,尽管可以通过单药治疗(包括青霉素或类似抗生素)有效地治疗某些克雷伯菌感染,但是对这些药物产生抗药性的生物的出现仍需要开发新的治疗方法。例如,肺炎克雷伯菌对β-内酰胺抗生素有抗性,β-内酰胺类抗生素包括碳青霉烯,青霉素和头孢菌素。

耐药性是由生物体合成称为碳青霉烯酶的酶的能力引起的,该酶会水解构成这些药物抗菌活性基础的β-内酰胺环。结果,耐药的肺炎克雷伯菌感染通常需要与结构多样的药物(例如β-内酰胺抗生素和氨基糖苷)联合治疗。

 手 术 

如果有脓肿,可能需要通过外科手术将其引流。根据脓肿的位置,这可能需要在诊所进行小手术,或者可能需要在医院进行外科手术。

通常,排脓后至少还需要几天的抗生素治疗。

其他治疗新方向——微生物群

肺炎克雷伯菌感染治疗有难度,因为大多数临床分离株均表现出对几种抗生素的抗性,从而导致治疗失败和全身性传播的可能性。

好消息是,国际顶级微生物学期刊《Nature microbiology》研究发现,成熟的微生物群推动了不同免疫防御程序的发展,从而在上呼吸道和肠道限制肺炎克雷伯氏菌在这些生态位内的定植。

肠道免疫保护取决于拟杆菌、白细胞介素IL-36信号和巨噬细胞的发育。拟杆菌的这种作用需要其保守的共生定植因子的多糖利用位点。相反,在上呼吸道,变形菌门通过IL-17A增强免疫力,但是肺炎克雷伯氏菌通过包囊IL-17A来克服这些防御进而有效定植

最终发现肺炎克雷伯氏菌的宿主间传播主要发生在其肠道贮存器中,而产生共生定植因子的拟杆菌足以通过IL-36阻止宿主之间的传播。

点此了解更多:

探索微生物前沿| 拟杆菌预防肺炎克雷伯菌定殖和传播

附录:预防感染肺炎克雷伯菌

有必要遵循所有预防措施,尤其是手部卫生。克雷伯氏菌主要通过人与人之间的接触传播,保持手部清洁是防止细菌传播的最佳方法

身体健康的人感染的几率较低,但是住院病人或免疫力低下者需要非常注意,勤洗手:

在准备食物或食用食物之前洗手;

使用浴室后洗手;

咳嗽、打喷嚏或擤鼻涕后洗手;

更换伤口敷料和绷带前后洗手;

在医院接触床头柜、床栏、门把手、遥控器和电话等表面后洗手。

早期诊断/治疗有助于降低发病率。

 主要参考文献:

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