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戴阿利斯特杆菌属 (Dialister)
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Dialister(戴阿利斯特杆菌属)是小的、厌氧或微需氧的革兰氏阴性球状或杆状菌,因次也被翻译成小杆菌属。
Dialister菌是人体肠道菌群中的一种常见菌种。该菌属物种被发现出现在人体全身各个部位,包括骨骼和血液,但是主要从人体粪便,口腔以及上呼吸道,阴道等部位分离或发现,属于人体肠道核心菌。
肠道菌群中Dialister菌属在96.15%的人群中检出,但平均丰度属于核心菌属中较低的,平均人群丰度为0.9%左右。
其中60.58%的人群中检出的是Dialister invisus,其次是55.77%的人检出Dialister sp.000434475,15.33%的Dialister propionicifaciens和12.98%的Dialister succinatiphilus(根据谷禾肠道菌群人群队列数据库)。
Dialister菌已在有症状和无症状的个体中被鉴定,因此被认为在正常微生物组中发挥了一定作用。目前尚不清楚这是如何发生的,但可以推断该菌所在身体环境与其致病或有益属性相关。
当在肠道中检出“Dialister invisus”与疾病无关,但是当在尿液中发现时,可能与尿路感染有关;当在口腔中检出“Dialister invisus”,它通常与冠周炎、边缘和根尖周炎、龋齿、口臭和牙髓感染有关。特别是“Dialister pneumosintes”被认为是一种新的牙周病病原体。
该菌属菌株难以与微小的革兰氏阴性厌氧球菌区分开来,所以在临床上比较难鉴定,一般需要分子方法,例如 16S rRNA 或宏基因组来鉴定。
Dialister 属于厚壁菌门,韦荣氏球菌科,代谢碳水化合物,产生琥珀酸和乙酸,丙酸,丁酸,产生组胺,过氧化氢酶。与抑郁症,自闭症、情绪控制、口腔疾病、减肥、强直性脊柱炎疾病,不同组织部位的感染,肾病等相关。
酸奶、胡桃、芽孢杆菌补充、双歧杆菌补充、菊粉以及运动可增加肠道Dialister 属的丰度。
Dialister(戴阿利斯特杆菌属)是厚壁菌门革兰氏阴性、厌氧杆菌。大部分菌种不形成孢子、不运动。产生琥珀酸和乙酸,丙酸,丁酸,产生组胺,过氧化氢酶。
已鉴定物种:
其中,D. pneumosintes和D. micraerophilus最常从临D. pneumosintes很难在常规培养基中生长,基于 16s rRNA 的 PCR 测定已开发用于检测这种病原体。这种微生物已从牙周炎、牙龈炎、根管感染、龈下菌斑 、人咬伤伤口感染 、呼吸道、头颈部感染 和阴道感染中分离出来。已报告严重的感染性并发症,包括脑脓肿 和肝脓肿,疑似牙源性感染。
Dialister 物种在人类感染中的作用已经明确,尽管真正的临床意义仍然未知。D. pneumosintes已从肺、血液、脑和上颌窦中分离出来和D. micraerophilus菌株已从多微生物培养物中的几个临床样本中得到表征。
Dialister 物种被认为是口腔、鼻咽、肠道和阴道菌群的共生生物。细菌可以从这些位置传播到各个器官,并可能导致严重的疾病,例如菌血症。患者的感染源可能是阴道菌群,尤其是当她经历过数次前庭大腺炎发作并接受过多种抗菌药物治疗时。正如先前报道的那样,应注意这些疾病,以避免传播到血液中。
Dialister菌属下的许多种都可能导致感染。例如,Dialister pneumosintes是一种常见的致病菌,可以导致呼吸道感染、皮肤感染和肠道感染。Dialister invisus也是一种常见的致病菌,可以导致呼吸道感染、皮肤感染和肠道感染。
其他常见的致病菌包括:
这些菌都可以导致许多不同类型的感染,包括呼吸道感染、皮肤感染和肠道感染。
应该注意的是,Dialister菌属下的所有种都不是总是致病的。在某些情况下,这些菌是人体的自然共生菌,并不会导致感染。然而,在免疫功能下降或者某些其他情况下,这些菌可能会导致感染。因此,应该根据临床症状和诊断结果来判断Dialister菌是否是致病的。
由于难以识别病原体, Dialister物种的抗菌药物敏感性数据仍然相对稀缺。Dialister分离株对根据 CLSI 指南测试的所有抗菌药物敏感,而 33 株菌株对一种或几种抗生素的敏感性降低,包括甲硝唑、红霉素、原始霉素、利福平、哌拉西林、左氧氟沙星和环丙沙星。
Dialister 已经从人类临床标本中分离出来,尤其是肺息肉,并且与人类临床感染有关,其中大多数是牙源性感染。
Dialister pneumosintes是一种不形成孢子、不运动、不发酵、革兰氏阴性厌氧杆菌。据报道,它作为正常菌群出现在鼻咽、口腔、肠道和阴道中。这种细菌于 1921 年首次在 1918-1919 年流感流行期间从患者的鼻咽分泌物中检测到,最初被命名为Bacterium pneumosintes.
Dialister pneumosintes 是一种与口腔感染相关的专性厌氧革兰氏阴性杆菌。研究报告了一名既往健康的 51 岁女性,她因 Dialister积气引起的肝脓肿作为牙脓肿的并发症就诊。通过在肝脏渗出液中使用广谱细菌 16S rRNA 基因 PCR 鉴定微生物。脓肿引流和 4 周抗生素治疗后,患者痊愈。
Dialister pneumosintes 是一种可疑的牙周病原体。它可以通过血行传播或区域传播影响身体的不同部位。这种微生物引起的牙周感染可能会引发潜在的危及生命的并发症。
D. invisus 物种于 2003 年由 J. Downes 首次发现,并通过 16S rRNA 测序从牙髓感染患者的根管中分离出来。D. invisus 主要从深牙周袋中回收,发现于龈缘以下。
由于 D. invisus 与边缘牙周炎、龋齿、口臭和根尖周炎有关,并且通常从牙髓感染中分离出来,因此它被认为是一种重要的人类病原体。了解持久存在的牙髓微生物(例如D. invisus)有助于确定牙髓感染患者的最佳治疗方案。为了控制或消除与牙髓病例相关的病原微生物,需要对这些病原体有透彻的了解。
由比利时鲁汶天主教大学的微生物学家 Jeroen Raes 领导的研究小组发现,被诊断患有抑郁症的人的肠道中缺乏的两种细菌。抑郁症患者的粪球菌 Coprococcus和Dialister菌也已耗尽。
虽然较低水平的Dialister与抑郁症有关,但最近的一篇论文将较高水平的Dialister与关节炎联系起来。Raes 说,可能是一种 Dialister 的流行增加了患关节炎的风险,而另一种的流行降低了患抑郁症的风险,但要确定这些细节还需要更多的研究。
安大略省圭尔夫大学微生物学教授 Emma Allen-Vercoe 表示,Coprococcus和Dialister可能是用作精神益生菌或针对心理健康的益生菌的理想候选者。
癌症是复杂的多因素疾病,被认为是一个全球性问题。Dialister 的终产物,如乙酸盐、乳酸盐和丙酸盐,似乎在致癌机制中起着重要作用。一项Meta调查人类癌症研究中微生物组与 Dialister 成分变化之间的关联。结果:荟萃分析包括 26 项研究,包含 1649 个对照样本和 1961 个癌症样本。与健康对照相比,Dialister 在癌症患者样本中显着升高。表明不同癌症类型与 Dialister 微生物组组成之间存在关系。
Lindefeldt 等人报告了 12 名儿童为治疗难治性癫痫开了生酮饮食,发现饮食处方的 alpha 多样性没有变化。双歧杆菌、直肠真杆菌和Dialister随着生酮饮食而减少。
Joossens 等人发现克罗恩病患者中有五种细菌具有生态失调的特征,即Dialister invisus减少,梭状芽胞杆菌簇 XIVa 的非特征性物种,Faecalibacterium prausnitzii和青春双歧杆菌,以及Ruminococcus gnavus增加。
食用油炸肉降低了肠道菌群的丰富度,以及毛螺菌科(Lachnospiraceae)和黄曲霉属(Flavonifractor)的丰度,同时增加了Dialister、多尔氏菌属(Dorea)和韦荣球菌属(Veillonella)的丰度(P FDR<0.05)。
通过比较3 个月后饮食转变 (DS) 从严重依赖肉食到素食和体育锻炼 (EX) 对肠道微生物组组成的影响发现,Dialister succinatiphilus的丰度被体育锻炼上调。
在一项先导性研究中,26名受试者采用了低热量、富含蔬果的饮食习惯,而其中有些人减重的幅度不如其他人高。对受试者肠道菌群的分析显示,有两类特定细菌的含量会影响减重速度,其中有一种为Dialister。
研究发现,比较容易减肥的人体肠道内考拉杆菌属(Phascolarctobacterium)水平较高,因此该菌也用来预测肥胖指标。而难以减肥的人体内则小类杆菌属(Dialister)水平较高。在难以减重的那部分人体内,这种细菌能够分解碳水化合物,更高效地利用其中的能量。
接受嗜酸乳杆菌和纤维二糖的健康志愿者表现出乳酸杆菌、双歧杆菌、柯林氏菌和真杆菌的水平升高,而Dialister降低了。
还有一些研究报告说,在1周龄时,非共生肠道细菌(如克雷伯氏菌和肠球菌)的相对丰度较高与1岁时的呼吸道感染有关;3 个月时链球菌的相对丰度与 5 岁时的特应性喘息有关;1岁时Rothia或Dialister的高相对丰度与4-5岁时哮喘相关。但是具体作用机制目前还不清楚。
发现 Dialister 属的丰度与强直性脊柱炎疾病活动评分呈正相关(Spearman 的 rho = 0.62,错误发现率 – 校正 q < 0.01)。在 SpA 患者和健康对照者的非发炎回肠和结肠活检组织中观察到的低频率 Dialister 进一步支持了这一发现。
Dialister 属会增加下列菌群的丰度:
Dialister 属会抑制下列菌群的丰度:
主要参考文献:
Morio F, Jean-Pierre H, Dubreuil L, et al. Antimicrobial susceptibilities and clinical sources of Dialister species. Antimicrobial Agents and Chemotherapy. 2007 Dec;51(12):4498-4501.
Wendy J. Dahl, … Jason M. Lambert, in Progress in Molecular Biology and Translational Science, 2020
Markus F. Neurath, in Mucosal Immunology (Fourth Edition), 2015
The Association of Fried Meat Consumption With the Gut Microbiota and Fecal Metabolites and Its Impact on Glucose Homoeostasis, Intestinal Endotoxin Levels, and Systemic Inflammation: A Randomized Controlled-Feeding Trial
Lkhagva E, Chung HJ, Ahn JS, Hong ST. Host Factors Affect the Gut Microbiome More Significantly than Diet Shift. Microorganisms. 2021;9(12):2520. Published 2021 Dec 6. doi:10.3390/microorganisms9122520
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粪球菌属(Coprococcus)
是厚壁菌门毛螺菌科重要成员,是肠道重要的菌属,菌种大部分从粪便中分离出来,积极发酵碳水化合物,是和Faecalibacterium prausnitzii 一样,丁酸的重要生产者之一。粪球菌可用作评估人体胃肠道健康状况的微生物生物标志物,Coprococcus属的细菌可能有助于抑制免疫反应,降低过敏反应的严重程度;Coprococcus的细菌有助于对 ACE 抑制剂产生耐药性,ACE 抑制剂是用于治疗高血压的主要药物类别之一。此外,该菌还与抑郁症,幼儿语言发育、便秘、睡眠以及慢性疲劳等相关。
细胞球状,直径0.8~1.5μm,有时椭圆形,成对或短链,革兰氏阳性,不运动,严格厌氧。最适生长温度37℃,多数物种分离于人的肠道和粪便,很少从人类临床标本中分离出来表明该菌主要定植于健康人的肠道。
需要注意的是,该菌需要与非常耐药且容易引起感染的肠球菌属(Enterococcus )区分开来,他们翻译的中文名虽然只差一个字,但是肠球菌能引发感染,以耐药性出名。
而粪球菌(Coprococcus)是厌氧球菌属,虽然它们都是人类粪便菌群的一部分。但是粪球菌积极发酵碳水化合物,产生丁酸和乙酸以及甲酸或丙酸和/或乳酸等。
在人类粪便中发现的最多产丁酸盐的细菌是属于梭菌簇 IV 和 XIVa 的对氧高度敏感的厌氧菌。其中包括许多以前未描述的与真杆菌属、罗斯氏菌属、普拉梭菌以及本文的粪球菌属。
该菌属主要至少包括以下物种:
Coprococcus catus (species)
Coprococcus comes (species)
Coprococcus eutactus (species)
Coprococcus sp. DJF_CR49 (species)
Coprococcus sp. L2-50
此属的模式种为(Coprococcus eutactus)
不同碳水化合物上的 Coprococcus 物种的生长不太一样,其中:
Coprococcus eutactus的丰度与肠道中更大的细菌基因丰富度有关,β-葡聚糖是与Coprococcus eutactus相关的人类肠道细菌的主要生长底物,其代谢产生丁酸盐和甲酸盐或乳酸。
此外,这两种菌可以利用广泛的碳水化合物底物:
Coprococcus. eutactus
Coprococcus sp. L2-50
但是,Coprococcus comes仅在葡萄糖上表现出良好的生长,而Coprococcus catus 仅在葡萄糖上表现出非常有限的生长,Coprococcus catus代谢产生丁酸盐和丙酸盐。
细菌互相作用或共同在一个生态位生存对整个菌群结构和宿主健康有很重要的影响,例如共现关系(例如,赋予抗生素耐药性)、共生关系(例如,交叉喂养其他成员产生的化合物)和协同作用。
研究报告Coprococcus和Roseburia之间的共现关系的支持,两者都属于Lachnospiraceae家族,表明系统发育密切相关的属也可能具有共现关系,而不是由于它们相似的栖息地偏好而总是相互竞争。然而,由于对人类肠道微生物群落的机理了解不足,因此应谨慎解释肠道细菌之间的生态联系。
此外还发现该菌属在生物化学上与瘤胃球菌密切相关。
值得注意的是,一项来自广东肠道微生物组计划的大规模队列数据,分析得出脱硫弧菌(DSV) 经常在人体肠道中发现,DSV的相对丰度与包括Oscillospira Coprococcus , Ruminococcus , Akkermansia,Roseburia , Faecalibacterium 和 Bacteroides呈正比。
人类肠道微生物群的物种组成对于弯曲杆菌感染的定植抗性很重要。相比于感染弯曲杆菌的人群,健康人群中Coprococcus丰度更好,表明高水平的Coprococcus有利于抵抗弯曲杆菌。
2019年比利时通过一项1070抑郁症病人的验证集小组发现,即使在控制了抗抑郁药的作用后,抑郁症患者的粪球菌属(Coprococcus)和小杆菌属(Dialister)细菌都已耗尽。
还发现Coprococcus具有与多巴胺相关的生物途径,多巴胺是一种会影响心理健康的神经递质。该研究的粪便宏基因组的肠脑模块分析确定,多巴胺代谢物 3,4-二羟基苯乙酸的微生物合成潜力与心理生活质量呈正相关,并表明微生物产生的γ-氨基丁酸在抑郁症中的潜在作用。
研究将重度抑郁症 (MDD) 患者的粪便微生物群移植 (FMT) 移植到大鼠体内,发现:相比较与移植健康粪便的大鼠, FMT-MDD大鼠瘤胃球菌科和毛螺菌属升高,而粪球菌属则被耗尽,从机理上表明粪球菌的缺乏会与抑郁症的关系。
另外一项对82 名抑郁的人随机分配接受多菌株益生菌加生物素治疗或生物素加安慰剂治疗 28 天。发现28天后,与接受安慰剂治疗的个体相比,精神症状的改善明显更高;同时粪便16s测试表明相比于安慰剂组,益生菌组的多样性高,Coprococcus 显著增加。
该研究的益生菌干预组为:包括九种菌株,双歧杆菌W23、乳酸双歧杆菌W51、乳酸双歧杆菌W52、嗜酸乳杆菌W22、干酪乳杆菌W56、副干酪乳杆菌W20、植物乳杆菌W62、唾液乳杆菌W24 和乳酸乳球菌W19。此外,益生菌产品中还添加了 125 毫克 D-生物素(维生素 B7)、30 毫克马尾草、30 毫克鱼胶原蛋白和 30 毫克角蛋白加基质。
帕金森病是一种神经退行性疾病,其特征是错误折叠的 α-突触核蛋白的细胞内聚集体沿脑轴聚集。一些研究报告了肠道菌群失调与帕金森病之间的关联,尽管因果关系仍有待确定。帕金森病组中最显著的变化突出了细菌类群的减少,特别是在毛螺菌科家庭和关键成员,例如丁酸弧菌属、粪球菌属(Coprococcus)和Blautia。
另外的研究发现帕金森病患者的结肠中有 α-突触核蛋白 (α-Syn) 聚集,并有结肠炎症的证据。PD患者的黏膜和粪便微生物群与对照组相比有显著差异,粪便样本比乙状结肠黏膜有更显著的差异。在属的分类水平上,来自 Blautia、Coprococcus和 Roseburia 属在对照组的粪便中明显多于 PD 患者。
此外,还有研究指出其他神经退行性疾病 (NDs)包括阿尔茨海默病 (AD)、多系统萎缩 (MSA)、多发性硬化症 (MS)、视神经脊髓炎(NMO) 和肌萎缩侧索硬化症 (ALS)中Faecalibacterium 、Coprococcus、Blautia 、 Prevotella减少。
一项针对136名3岁乌干达儿童粪便样本研究表明,产丁酸盐的肠道细菌Coprococcus eutactus可以作为乌干达农村三岁儿童语言发展的预测因子。
该研究模型指出3岁时语言发展高于平均水平的儿童,在其2岁时粪便中有相对较高水平的Coprococcus eutactus,语言发育低的儿童中Coprococcus 属平均丰度低,而且该研究表明早期获得产丁酸盐Coprococcus eutactus对语言发展的重要性,而在在语言发育受损的儿童中,耐氧物种的优势增加。
湿疹的严重程度一般与微生物群多样性和产生丁酸盐的细菌的丰度呈负相关,尤其产生丁酸盐的Coprococcus eutactus相关细菌的降低。我们数据库数据和案例也显示过敏和哮喘的儿童Coprococcus丰度很低或显著低于健康儿童。
自闭症谱系障碍 (ASD) 是世界范围内普遍存在的神经生物学疾病,原因复杂。多项研究表明自闭症儿童Coprococcus、Prevotella、Blautia 、Lachnospiraceae和Ruminococcaceae属的丰度较低。
睡眠在儿童的身心发展中发挥着重要作用。一项针对学龄前儿童(4.37 ±0.48 岁,n=143)的睡眠与肠道微生物群之间的关系研究表明拟杆菌中双歧杆菌的相对丰度较高,在睡眠效率较高和入睡后醒来时间较低(LDA 评分 >2)的儿童中较高。相比之下,包括 Blautia 和 Coprococcus 在内的一些毛螺菌科成员分别与较短的夜间睡眠时间和较低的效率相关。
慢性便秘是全球最常见的胃肠道疾病之一。然而,其发病机制在很大程度上仍不清楚。在便秘患者的肠道微生物组中,产生丁酸盐的 Roseburia、Coprococcus和 Faecalibacterium 属的丰度很低。不存在便秘状态的特定微生物生物标志物,整个肠道微生物群在都可能发挥作用。
此外,功能性便秘(FC)个体的肠道微生物群被证明缺乏属于拟杆菌属、罗斯氏菌属和 Coprococcus 的成员。与对照相比,FC 相对应的微生物组显示出高丰度的参与制氢、产甲烷和甘油降解的基因。
新出现的证据表明,肠道菌群失调与慢性肾脏病 (CKD) 的发病机制有关,其潜在机制涉及粘膜和/或系统免疫或代谢紊乱。
一项纳入1436 名慢性肾病的meta分析显示终末期肾病 (ESRD)患者中普氏菌属、粪球菌属、巨单胞菌属和粪杆菌属的丰度较低。
虚弱是一种常见的老年综合征,与不良健康后果的风险相关。从 176 名韩国老年人的粪便样本中获得的 16S rRNA 基因测序数据研究了虚弱测量与肠道微生物组的关联。发现在较虚弱的个体中,普氏菌和 Coprococcus eutactus的丰度减少。
先兆子痫是一种以高血压和多个器官功能障碍为特征的妊娠特异性疾病,与母体和胎儿并发症有关。
对 213 名孕妇的粪便样本进行 16S rRNA 基因扩增子测序,调查了妊娠 28 周时发生迟发性(>34 孕周)先兆子痫 (DPE) 的女性的肠道微生物群组成发现产丁酸的丰富粪球菌属在 DPE 中显著减少。产生丁酸盐的细菌特别是Coprococcus spp. 丰度的减少可能会增加孕妇患先兆子痫的风险。
此外,研究发现喹那普利在降低肠道菌群负荷较低的高血压大鼠的血压方面更有效。当他们分析肠道微生物群的组成时,Coprococcus 属成为一个重要的参与者。
早期乳腺癌 (BC) 患者和健康对照者的粪便微生物群分析对比表明早期 BC 的患者中微生物多样性的减少、Odoribacter、Butyricimonas和Coprococcus 的相对丰度降低的趋势。
慢性广泛性肌肉骨骼疼痛 (CWP) 是纤维肌痛的特征性症状,已被证明与肠道微生物组的改变有关。在 CWP 病例中,Coprococcus的物种显著减少 。
维生素 D 会增加瘤胃球菌科、阿克曼氏菌、粪杆菌和粪球菌的增加。
在整个人群中,Coprococcus 的变化与体重、总胆固醇和甘油三酯的变化呈正相关,与 HDL 胆固醇呈负相关。
银屑病是一种常见的慢性复发性皮炎。瘤胃球菌科、 Coprococcus_1属和Blautia属的丰度随着银屑病的改善而降低( p< 0.05),这已被证明在银屑病中显著增加。
但是也有研究指出观察到 Coprococcus属减少。这些研究队列都只有几十例,需要更大队列验证。
小檗碱和二甲双胍都是源自草药的成熟药剂,对包括糖尿病在内的多种疾病具有偶然的有益作用。使用二甲双胍或小檗碱干预 db/db 小鼠的肠道微生物群,增加产短链脂肪酸的细菌(例如,丁酸单胞菌属、粪球菌属、瘤胃球菌属)的数量。
补充维生素 D 对 26 种维生素 D 缺乏(25-羟基维生素 D (25(OH)D) ≤50 nmol/L)、超重或肥胖(BMI ≥25 kg/m 2) 其他健康的成年人。
一项研究是 2014 年至 2016 年间进行的基于社区的双盲随机临床试验的辅助研究。参与者在基线和 100,000 国际单位 (IU) 负荷剂量的胆钙化醇之后提供粪便样本,然后每天 4000 IU 或匹配安慰剂 16周。与25(OH)D <50 nmol/L的个体相比,25(OH)D >75 nmol/L 的个体的粪球菌属丰度增高。
关节和肠道炎症之间的密切关系早已为人所知。20 名受肠病性关节炎影响的患者,他们从未接受过生物药物治疗,在基线时和治疗 6 个月后接受了 TNFi 治疗。所有患者都遵循地中海饮食。治疗后6个月毛螺菌科和粪球菌属显著增加。
甘草甜素 (GL) 是一种三萜糖苷,在各种生物活性中发挥重要作用,包括抗病毒和抗肿瘤免疫反应。菌群分析表明 GL 降低Akkermansia、Sutterella、 Prevotella和Coprococcus 。
紫薯中提取的抗性淀粉 (RS) 有利于增加Coprococcus的丰度。
胞外多糖 (EPS) 是合成并存在于双歧杆菌表面的碳水化合物聚合物。由于其在食品、生物技术、化妆品和医药等多个领域的潜在应用,双歧杆菌 EPS 促进了 Coprococcus 属的生长。与淀粉组相比,EPS 还增加了丙酸的产生。
甘草甜素 (GL) 是一种三萜糖苷,在各种生物活性中发挥重要作用,包括抗病毒和抗肿瘤免疫反应。菌群分析表明 GL 降低Akkermansia、Sutterella、 Prevotella和Coprococcus 。
主要参考文献:
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