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谷禾健康
每个人身上都有“独特的味道”。有些人身上的味道几乎感受不到，而有些人身上却会出现令人尴尬的“体臭”。
慢性体臭可能带来许多不便，焦虑，自尊降低和生活质量下降，社交困难，甚至导致严重的心理问题。
人体会通过呼吸，唾液，汗水（皮肤），尿液或生殖器官液体释放出有气味的物质，主要的气味物质是小的挥发性化合物。
越来越多的证据表明，微生物群在人类的生理过程中起着至关重要的作用。它可能通过产生大量有气味的分子（例如氨，挥发性硫化合物或三甲胺）来加剧人体臭味。
本文我们来讨论下关于体臭最常见的原因，以及潜在的治疗选择。
化合物的过度积累会产生难闻的气味。与体液中细菌代谢物积聚相关的体臭可能由以下一种或多种原因引起：
主要的细菌气味物质及其散发部位
Mogilnickaet al., Int J Mol Sci, 2020
接下来，我们针对身体各个部位气味及其原因逐一解读。
口臭(口腔之味或呼吸之味)是一种以口腔内或口腔外的口臭为特征的疾病。全世界约有20-50%的成人或青少年患有口臭。[更精确的数字，为31.8%（95%可信区间24.6–39.0%）]
在绝大多数(80-90%)持续口臭的患者中，口臭的原因是口腔原因，其中舌苔和牙周病最为普遍。
在口臭的口外(非口)原因中，还包括糖尿病酮症酸中毒，先天性代谢性疾病，胃肠道或呼吸疾病等。
当然，尽管口臭可能是一些严重疾病的征兆，但食用洋葱或大蒜等几种食物以及吸烟也可能导致口臭。
口臭患者呼吸中存在的主要物质是挥发性硫化合物，如硫化氢(H2S)、乙硫醇、硫代乙酸乙酯、二乙基二硫化物、二甲基硫化物((CH3)2S) 和甲硫醇(CH3SH或甲硫醇)。
一些革兰氏阴性菌与食物或唾液中含硫底物产生挥发性硫化合物有关，如：
福赛拟杆菌Bacteroides forsythus、牙龈卟啉单胞菌Porphyromonas gingivalis、放线共生放线杆菌Actinobacillus actinomycetemcomitans 、中间普雷沃氏菌Prevotella intermedia.
最常见的细菌气味
Mogilnickaet al., Int J Mol Sci, 2020
与恶臭相关的疾病
Mogilnickaet al., Int J Mol Sci, 2020
H2S——臭鸡蛋的气味
在低浓度下，硫化氢(H2S)是一种重要的生物介质，类似于其他气体递质，如一氧化氮或一氧化碳。然而，在较高的浓度下，H2S最出名的是它的毒性作用和特殊的臭味，经常被比作臭鸡蛋的气味。H2S即使浓度很低，也会产生明显的气味。
众所周知，口腔中存在的厌氧菌（龈下微生物群）可能会将含有氨基磺酸半胱氨酸的脱硫物质降解为有气味的挥发性硫化合物，而H2S是难闻呼吸气味的重要来源。
几十年前，已经报道了产生硫化氢的菌属，如：
多齿拟杆菌Treponema denticola 和中间拟杆菌Bacteroides intermedius，以及其他属如消化链球菌Peptostreptococcus、真细菌Eubacterium和梭杆菌Fusobacterium。
多年后确定，口腔异味患者以韦荣氏球菌属Veillonella、放线菌属Actinomyces、普雷沃氏菌属 Prevotella 为主。
另一方面有研究认为，在呼出高浓度H2S的患者口腔中占优势的菌：奈瑟氏球菌属 Neisseria、梭杆菌属Fusobacterium、卟啉单胞菌属 Porphyromonas.
而以CH3SH为主的患者口腔中以韦荣氏球菌属Veilonella和普雷沃氏菌属Prevotella为主。
在某些食品中，可能存在由细菌还原酶生产H2S的底物。例如，洋葱，大蒜，葡萄酒，卷心菜，花椰菜，蘑菇，坚果，土豆和干果含有硫化物和亚硫酸盐(用作抗菌和抗氧化剂)。
甲硫醇(CH3SH/MT/MeSH) ——腐败、霉味
在口臭患者的呼吸中检测到的另一种分子是甲硫醇。研究表明CH3SH是口腔内口臭的主要致病因素。MT的气味常被形容为腐臭、霉味，可比作谷仓气味。
事实上，口臭患者的恶臭通常更类似于臭鸡蛋的气味(H2S的特征)。客观存在的阈值为0.5 nM (12 ppb) 。与H2S类似，口外(血源性)口臭患者的口腔空气中也检测不到甲基叔丁基醚，而其他口腔鳞状细胞癌在其中起着至关重要的作用。
研究人员报告说，在口臭患者唾液中，普雷沃氏菌 Prevotella、韦荣氏球菌Veillonella、阿托波毕姆菌Atopobium、巨形球菌Megasphaera和硒单胞菌Selenomonas的丰度很高，并怀疑这些菌群参与CH3SH的产生。
对口腔恶臭患者口腔气体中的金属硫蛋白含量测量，发现在患有牙周病的个体中显著增加的浓度。
其他挥发性硫化合物——熟洋葱的甜味和霉味
口臭患者的呼吸和唾液中检测到的其他挥发性含硫化合物包括乙硫醇、硫代乙酸乙酯、二乙基二硫化物和二甲基硫化物。这些化合物与蔬菜独特的、甜的、发霉的气味有关，通常类似于熟洋葱的气味。
二甲基硫(DMS，CH3SCH3)是血液传播(口外)臭味的主要来源。相比之下，口腔内口臭患者口腔和鼻子呼吸中的二甲基硫浓度在正常范围内，未达到气味阈值。
血液中存在二甲基硫的可能原因是代谢紊乱。文献中报道的其他原因包括肝衰竭、高硫氨酸血症(一种主要与甲硫氨酸水平升高相关的遗传性甲基化障碍)和治疗性摄入二甲亚砜或半胱胺。
三甲胺——鱼腥味
三甲胺(TMA)是一种挥发性的脂肪族叔胺，因其腐烂鱼的特有气味和高浓度的毒性作用而闻名。它是由肠道细菌产生的过量胆碱和其他含TMA的膳食营养素形成的。
已经表明，许多肠道中的共生细菌通过代谢膳食中含有TMA的物质来产生TMA，
例如，厌氧球菌属Anaerococcus、普罗维登夏氏菌属Providencia、爱德华氏菌属Edwardsiella、梭菌属Clostridium、柯林塞拉氏菌属Collinsella、脱硫弧菌属Desulfovibrio、乳杆菌属Lactobacillus 和 变形杆菌属Proteus.
从肠道吸收后，TMA被肝脏氧化成几乎无味的三甲胺氧化物(TMAO)。在三甲基胺尿症(也叫TMAu或“鱼味综合征”)中，由于缺乏含鸟苷的单加氧酶3 (FMO3)，一种氧化TMA的肝酶，TMA积累并排泄到体液中。
继发性(获得性)TMau在患有严重肝脏或肾脏疾病患者中。文献中还描述了儿童（与含胆碱的食物补充剂摄入有关）和妇女（与月经有关）的短暂形式。这种代谢障碍导致底物超载和独特的体臭，可以在包括呼吸在内的多个身体部位检测到。
吲哚和甲基吲哚——粪便的气味
吲哚代表一组微生物来源的化合物，由色氨酸产生，色氨酸是一种必需氨基酸，是色胺、血清素和褪黑激素内源性合成的前体。
被怀疑导致口臭的吲哚包括吲哚和甲基吲哚，它们是由口腔内厌氧革兰氏阴性菌产生的，如：
中间卟啉单胞菌Porphyromonas intermedia、具核梭杆菌Fusobacterium nucleatum和牙龈卟啉单胞菌Porphyromonas gingivalis.
它们的气味可以等同于粪便的气味，而这两种化合物的气味更浓。与挥发性含硫化合物相比，吲哚和甲基吲哚的挥发性要低得多，因此，它们对口臭的影响相当小。
然而，有些口臭患者呼吸中可能存在无法检测到的VSCs浓度以及高水平的吲哚，在这样一组患者中，常用的用于测定口气气味的工具(如检测VSCs的口臭计)可能不够充分并延误诊断。
腐胺和尸胺——腐肉或鱼的气味
腐胺和尸胺这两种二胺一直被怀疑是造成口臭的原因，都与牙菌斑中的细菌引起的食物腐败有关。
它们在唾液中通过氨基酸脱羧（分别是赖氨酸和鸟氨酸）或转氨作用产生。
腐胺的气味常被比作变质的鱼或腐肉的气味，而尸胺的气味除了上述气味之外，还可能会让人联想到尿液或精液的气味。口臭和唾液中存在尸胺有强相关性。
丙酮——水果味
丙酮是一种三碳挥发性酮，来源于乙酰乙酸酯(通过脱羧或酶促转化)。长期以来，它的水果味(常被比作烂苹果的味道)一直与糖尿病(DM)有关。
高浓度的呼吸丙酮与糖尿病酮症酸中毒有关。它也随着禁食、高脂肪或生酮饮食而增加。
吡啶——鱼腥味、汗味
吡啶是一种芳香的含氮挥发性化合物，有一种鱼腥味和汗味，可能会导致口臭。在中度和重度牙周病患者的培养唾液中发现了吡啶及其类似物(2-,3-和4-甲基吡啶)。相比之下，这些分子在口腔健康患者的样本中是不存在的。
氨——类似尿液的气味
氨(NH3)以铵离子(NH4+)的形式存在于所有体液中，但其高浓度是有毒的，因此它由尿素循环精确调节。氨在肝脏和肾脏疾病以及口臭中作为生物标志物发挥着重要作用。
去除舌苔和牙菌斑后呼吸中氨水平的降低，这可能表明口腔中存在的一些微生物是口腔内口臭中氨产生的原因。
在患有终末期肾病(ESRD)的患者中，尿毒症呼吸气味是由唾液中的高浓度尿素引起的，尿素被分解成氨。多达34.1%的ESRD患者主诉尿毒症恶臭。
肝衰竭历来与尿样胎儿肝性脑病(肝性呼吸)有关。比较肝硬化患者和非肝硬化患者的血氨和呼吸氨水平，患有肝性脑病的患者的呼吸氨水平明显高于对照组。此外，呼吸和血氨随着高氨血症的治疗而降低。
肠道细菌是哺乳动物体内氨形成的重要因素。胃肠道细菌(主要是革兰氏阴性肠杆菌科)产生脲酶，将尿素水解成二氧化碳和氨。其他细菌菌株，例如大肠杆菌和肠道沙门氏菌，能够通过半胱氨酸脱硫酶从半胱氨酸形成氨。
此外，大肠杆菌还可以将硝酸盐还原成氨。源自肠道的氨被肠道细菌用于蛋白质再合成，通过GBB(肠道-血液屏障)被吸收到循环中，或者随粪便排出体外。在正常情况下，肠道中产生的氨在肝脏中代谢。然而，在肝衰竭状态下，它不能转化为无毒衍生物，如尿素或谷氨酰胺。
因为氨也是在蛋白质分解代谢过程中形成的，所以可以假设富含蛋白质的饮食可能会增加其血液水平，并导致更多的口呼出氨。研究表明，蛋白质的摄入导致血清和唾液尿素增加，从而导致呼吸氨浓度增加。这一点需要认识到，尤其是因为许多流行的、不健康的时尚饮食是基于高蛋白的摄入。
尿液成分受身体新陈代谢的影响，但也受消耗的食物和饮料的影响。因此，需要强调的是，并不是尿液中发现的每一种气味都是不好的。
例如，在摄入芦笋后不久，有些人的尿液可能会有明显的硫磺味（想象煮熟的卷心菜）。虽然导致这种气味的确切分子还没有被明确地鉴定出来，但是一些类似甲硫醇或二甲基硫醚的挥发性物质是可疑的。
尿液中特殊气味化合物的鉴定可能有助于诊断苯丙酮尿症，高硫氨酸血症或枫糖尿症。值得一提的是，多种有气味的物质是由肠道菌群产生的，它们可以在从肠道吸收到循环系统后出现在尿液中。
下面将介绍几种影响尿液气味的物质。
H2S ——臭鸡蛋的味道
在尿失禁（UI，不自觉的尿液泄漏，显著影响生活质量）患者中，出现难闻的气味，也是造成社会尴尬的重要原因。
研究尿液和吸收性失禁垫主要挥发性气味物质，与甲硫醇和醛类等其他分子一起，硫化氢被检测到高于气味阈值。此外，在尿路感染中，大肠杆菌是恶臭硫化氢的常见产生者。
甲硫醇 ——腐败、霉味
健康人尿液中的气态甲硫醇低于检测阈值。在用半胱胺治疗的患者，肝甲硫氨酸腺苷转移酶缺乏症和UI 中发现水平升高。甲硫醇产生的主要因素是肠道细菌群，如大肠杆菌、柠檬酸杆菌和变形杆菌。甲硫醇从肠道吸收，进入循环，然后可以随尿液排出。
三甲胺——鱼腥味
在三甲胺尿中，过量的三甲胺不能被氧化成无味的TMAO，分泌到包括尿液在内的多种体液中。需要强调的是，一些患者只有间歇性TMAu，这使得建立正确的诊断更加困难，因为尿液测试可能在气味不明显的期间呈阴性，必须重复进行。
例如，来月经的女性应该在月经期间或之前进行测试，以最大限度地增加检测TMAu的机会，因为在此期间TMA的排泄会增加。
尿中TMA的另一个来源可能是肠道菌群，主要是
厌氧球菌Anaerococcus,普罗维登夏氏菌 Providencia, 爱德华氏菌Edwardsiella,梭状芽孢杆菌Clostridium, 柯林塞拉氏菌Collinsella, 脱硫弧菌Desulfovibrio,乳杆菌Lactobacillus,变形杆菌Proteus.
短链脂肪酸——干酪味
异戊酸血症(IA)通常与“汗脚”或人体呕吐物的特殊干酪样体臭有关，这在代谢危机期间可以注意到。这种疾病是异戊酰辅酶a脱氢酶(IVD)缺乏导致亮氨酸代谢异常的结果。在IA患者的尿液中可以检测到的病理物质是异戊酰甘氨酸。
氨——类似尿液的气味
氨是第一批被认为会在尿失禁患者周围引起恶臭的分子之一。根据这一概念，细菌尿素酶（主要是大肠杆菌、奇异变形杆菌Proteus mirabilis和粪肠球菌 Enterococcus faecalis）会将尿素分解成难闻的氨。然而，也有研究人员对这一假设提出质疑。
蛋氨酸及其代谢物——腐臭黄油或煮卷心菜的气味
甲硫氨酸腺苷转移酶(MAT) I/III缺乏是甲硫氨酸代谢的遗传性错误，主要在新生儿筛查中发现。它是由导致蛋氨酸及其代谢物积累的MAT1A基因突变引起的。是持续性孤立性高硫血症最常见的原因。
苯乙酸盐——霉味、鼠味
另一个导致尿液有独特的类似老鼠气味的原因是苯丙酮尿症(PKU)。
支链氨基酸(亮氨酸、异亮氨酸和缬氨酸)及其酮酸——焦糖或枫糖浆的气味
枫糖浆尿病(MSUD，亮氨酸病)是另一种代谢紊乱，其症状之一是有明显的尿气味。
3-羟基异戊酸——雄性猫尿的气味
在3-甲基巴豆酰辅酶a羧化酶(3-MCC)缺乏的其他症状中，一些研究人员报告了尿液的特殊气味。
醛类(乙醛、丁醛、异戊醛)——类似尿液的气味
在尿失禁患者的尿液样本和尿失禁卫生垫中检测到少量有气味的醛类物质。据报道，乙醛、丁醛、异戊醛(具有恶臭、类似尿液的气味)的浓度高于检测阈值，可以假设它们有效地增加了UI患者的气味强度。尿醛的来源至少部分是肠道及其微生物群。
从皮肤表面散发出的气味分子大多来自汗液，汗液是汗腺分泌的产物。人体汗腺主要分三种类型：大汗腺、小汗腺和大小汗腺(混合型)。
小汗腺产生大量的汗液，主要含有水和电解质，它们几乎分布在整个身体表面。
大汗腺大多位于腋窝、会阴、生殖器区域和乳头周围。它们在青春期后变得活跃，分泌的汗液比外分泌腺少。
大汗腺分泌的汗液类似于小汗腺产生的汗液，但其分泌速率较高，尤其出现在腋窝部位。这些特征使得大汗腺成为腋窝出汗的重要原因。
顶泌汗液是无味的，它只有被皮肤表面的微生物分解后才会变得有气味，如微球菌科Micrococcaceae、好氧类白喉菌aerobic diphtheroids 和丙酸杆菌Propionibacteria。
激素平衡的变化、消耗的食物和新陈代谢的变化可能会对汗水的数量和质量构成产生影响。
皮肤微生物群的任何变化以及细菌感染都可能改变汗液的成分，通常会产生独特的气味，因为人类有机体与几种能够转化汗液化合物的微生物物种保持共生关系。
据报道，在链球菌性皮炎中，患者皮肤有一种独特的臭味。
此外，许多代谢疾病的特征是皮肤散发出各种气味。其中一些疾病包括苯丙酮尿症，甲硫氨酸吸收不良综合征，高硫氨酸血症，或TMAu。
下面将讨论已知会导致皮肤散发气味的物质。
E3M2H，HMHA，MSH——发臭、发臭的汗味
体臭，是一种令人尴尬痛苦的疾病，特别是在腋窝、生殖器或脚等部位。
这三种类型的汗腺都在这种疾病的发病机制中起作用。过度出汗后，细菌分解汗液成分，会产生难闻的汗味。与小汗腺腋臭相反，大汗腺腋臭在青春期后出现，是这种疾病最常见的形式。
细菌将顶泌汗液分解成许多挥发性分子，如氨和短链脂肪酸，例如(E)-3-甲基-2-己烯酸(E3M2H) ，这是一种C7支链和不饱和酸。它有一种非常强烈的刺鼻气味。
Natsch等人报道了有气味的E3M2H及其水合类似物，(R)/(S)-3-羟基-3-甲基己酸((R)/(S)-HMHA)是由位于腋窝皮肤上的共生棒状杆菌物种的特定锌依赖性N-α-酰基-谷氨酰胺氨酰酶(N-AGA)从谷氨酰胺缀合物(存在于腋窝分泌物中)中释放出来的。
HMHA(以腐臭、奶酪味为特征)是最丰富的。3-甲基-3-磺酰己-1-醇的(S)-异构体((R)/(S)-MSH)及其洋葱味和类似鼠尾草的气味是引起腋臭的另一种颗粒。
此外，多种因素与小汗腺腋臭有关。这些包括摄入某些食物产品，如大蒜或洋葱，角蛋白的细菌降解，代谢紊乱和多汗症。
三甲胺——鱼腥味
在TMAu患者中，过量的未代谢的三甲胺也会从皮肤表面渗出(伴有汗液)，引起特有的鱼腥味体臭，无论患者的个人卫生状况如何，都会有这种体臭。
在对患有特发性恶臭的患者进行的一项研究中，约三分之一的患者三甲基胺尿检测呈阳性。在这些个体中，自我识别的体臭是主要症状(29.9%)，其次是体臭和口臭(21.4%)。
然而，只有5%的TMAu阳性患者确实在手掌上检测到明显的恶臭，并且他们中没有人在社交距离处发出明显的体臭。在摄入胆碱(合成TMA的一种底物)后，多达10%受试者在社交距离内有明显的体臭。
氨——类似尿液的气味
研究表明，汗液中含有氨。然而，汗液中的氨来源尚未得到证实。一些研究人员认为它是从血浆中运输的，而其他人则认为它直接来自汗腺。
比较呼吸和汗液中氨浓度的研究结果也没有定论。一项研究表明，有气味的氨的皮肤释放量高于呼气。另一项研究则认为，皮肤气体中的氨含量比呼吸中的低。
蛋氨酸及其代谢物——腐臭黄油或煮卷心菜的气味
在新生儿筛查中未确诊的蛋氨酸腺苷转移酶I/III缺乏症(导致高蛋氨酸血症)患者，不仅在呼吸或尿液中，而且在汗液中可能会发现类似水煮卷心菜或腐臭黄油的特殊气味。这种独特的气味很可能是由蛋氨酸形成的有气味的二甲基硫引起的。
2-壬烯醛–油腻、青草味
自然身体气味的化学成分、强度和宜人性在一生中都会发生变化。众所周知，老年人有一种特殊的体臭，有时称“老人气味”。
研究人员对与衰老相关的体臭变化进行研究，发现了一种特殊的粒子，2-壬烯醛，它是老年人和中年人身体气味的特征。
这种不饱和醛具有独特的油腻和青草气味，是由皮肤表面脂质中的ω-7单不饱和脂肪酸降解产生的。
正常阴道分泌物：几乎无气味或有类似酸奶的气味。
与生殖液体一起释放的干酪味或鱼腥味可能是位于生殖器区域的感染(例如，细菌性阴道病、滴虫病或念珠菌病)以及非感染疾病(例如尿失禁、恶性溃疡、三甲基铵尿症或慢性便秘)的症状。
细菌性阴道病是阴道气味最常见的原因。其他症状包括阴道分泌物、瘙痒和刺激。这种情况下阴道液的异常腥味是由阴道加德纳氏菌Gardnerella vaginalis 等细菌产生的挥发性胺(腐胺、尸胺、TMA)引起的。在大多数情况下，细菌性阴道病可以用抗生素迅速治愈。然而，在大约三分之一的患者中，常规治疗并不能改善症状。
阴道气味的非感染性原因比感染性原因更不常见，因此它们构成了更大的临床挑战。医生也应该认识到，阴道的气味可能有不同的来源，如肛管或尿道。生殖器汗味的难闻气味也可能被误认为是阴道气味。
胃肠疾病，如慢性便秘和大便失禁，也应被视为肛门生殖器区域散发恶臭的可能原因。在这些状态下，挥发性有气味的化合物包括硫化氢、甲硫醇和二甲基硫化物，它们是造成屁和粪便气味的原因。这些患者的阴道检查不会显示任何异常。
最后，一些妇科肿瘤和病变患者抱怨阴道分泌物带有恶臭。例如，伴有坏死的外阴恶性溃疡可能导致腐烂气味，这可能是由于细菌形成腐胺、尸胺、短链脂肪酸(异戊酸和丁酸)和含硫化合物。
遗憾的是，缺乏管理体臭的循证指南，也没有普遍的治疗方法。医学文献中已经讨论了几种临时解决方案，如刷牙、漱口、嚼口香糖或经常用抗菌肥皂洗澡和使用除臭剂。然而，这些方法不能解决潜在的问题，而是掩盖或减少不愉快的气味到可接受的水平。只有把原因考虑进去，才能取得令人满意的结果。
一般来说，与体液中细菌代谢物积累相关的恶臭是由气味物质的合成和排泄之间的不平衡引起的。
可能是由以下一个或多个因素引起的：
(1) 含有气味物质或其产生底物的饮食
(2) “前气味”细菌组成和细菌的代谢活性
(3) 增加从肠道对气味物质或其前体的吸收(增加肠道转运时间，增加肠道-血液屏障通透性)
(4) 减少气味物质的肝脏代谢
(5) 减少尿排泄
基于以上所述，除了标准的卫生程序之外，还可以建议一些一般的但不是基于证据的预防措施。
1. 减少产生气味的食物基质。
2. 经常排便以减少通过时间(缩短肠道细菌代谢时间和细菌代谢物吸收时间)，治疗便秘。
3. 益生菌和益生元治疗(尝试改变肠道细菌组成)。
4. 多喝水，以增加代谢物随尿液的排泄。
下表总结了与细菌气味剂有关体味的治疗选择。根据气味类型进行管理：
Mogilnickaet al., Int J Mol Sci, 2020
目前为止，已经确定了几种导致体臭的化合物，其中大多数是细菌来源的。虽然没有基于证据的管理身体恶臭的指南，一些针对饮食、肠道菌群组成的治疗措施可能会减轻症状。需要提高临床认识以及进一步的研究来解决体臭问题。
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参考文献：
Li, M.; Al-Sarraf, A.; Sinclair, G.; Frohlich, J. Fish odour syndrome. CMAJ 2011, 183, 929–931.
Rath, S.; Heidrich, B.; Pieper, D.H.; Vital, M. Uncovering the trimethylamine-producing bacteria of the human gut microbiota. Microbiome 2017, 5, 54
Piotr, K.; Marcin, U. Indoles – Gut Bacteria Metabolites of Tryptophan with Pharmacotherapeutic Potential.Curr. Drug Metab. 2018, 19, 883–890
Mogilnicka Izabella,Bogucki Pawel,Ufnal Marcin,Microbiota and Malodor-Etiology and Management.[J] .Int J Mol Sci, 2020, 21.
Bielinska, K.; Radkowski, M.; Grochowska, M.; Perlejewski, K.; Huc, T.; Jaworska, K.; Motooka, D.; Nakamura, S.; Ufnal, M. High salt intake increases plasma trimethylamine N-oxide (TMAO) concentration and produces gut dysbiosis in rats. Nutrition 2018, 54, 33–39
Suzuki, N.; Nakano, Y .; Watanabe, T.; Yoneda, M.; Hirofuji, T.; Hanioka, T. Two mechanisms of oral malodorinhibition by zinc ions. J. Appl. Oral Sci. 2018, 26, e20170161
谷禾健康
韦荣氏球菌属（Veillonella）是革兰氏阴性厌氧性微小球菌，直径0.3～0.5μm，初期培植为革兰氏阳性，过夜转为阴性。光学显微镜下为双球状、片状和短链状，无荚膜，无鞭毛，无芽孢。最适生长温度37℃，最适pH6.5～8.0。
Veillonella该属的成员是非发酵的，它们无法使用碳水化合物或氨基酸，不发酵无法葡萄糖或任何其他碳水化合物（除了有一个种发酵果糖外）或氨基酸，但它们会积极发酵发酵丙酮酸、乳酸、苹果酸、富马酸和草酰乙酸。胰蛋白酶-葡萄糖-酵母提取物肉汤中的主要代谢终产物是乙酸和丙酸。能代谢乳酸产生丙酸、CO2和H2。一些物种产生一种缺乏卟啉的非典型过氧化氢酶。大多数菌株产生气体，如H2S。
在动物和人的自然腔道中大量存在，是分布于口腔、咽部、呼吸道、消化道的常见菌群。其粘附于表面或与其他细菌并形成生物膜的能力对于肠道和口腔微生物群组成和功能至关重要，尤其是在口咽和肠道中。 在一些严重的感染过程中，如菌血症、骨髓炎和心内膜炎，在各种混合感染中起作用。常从软组织脓肿及血液中检出。青霉素已被建议作为韦韦氏菌属病原体感染的治疗选择 。
Veillonella属最早于1898年被Veillon和Zuber分离。Prevot在1933年进一步描述了这些细菌，并提出了目前的分类法。
大多数Veillonella菌是从脓肿，吸入性肺炎，烧伤，叮咬和鼻窦中回收的。在95％例患者中感染是多菌种，但在5％例患者中，纯培养物中回收Veillonella。与该菌检出相关的诱因条件是先前的手术，恶性肿瘤，类固醇治疗，异物和免疫缺陷。。
已知的Veillonella属中已描述了超过10种。
人类样品分离出（齿状Veillonella denticariosi，Veillonella dispar，Veillonella montpellierensis，Veillonella rogosae 和 Veillonella tobetsuensis）
非人类动物样品分离出（Veillonella caviae，Veillonella criceti，Veillonella magna，Veillonella ratti和Veillonella rodentium）
Veillonella atenty 从人和其他动物来源分离出。
它们的表型特征，包括形态，主要代谢终产物，产气，硝酸盐还原和琥珀酸脱羧，这些菌株被鉴定为Veillonella属的成员。 多基因座序列分析和相应的系统发育基于16S rRNA，dnaK和rpoB基因，以及新近提出的gltA基因。
其中一个重要的菌种，小韦荣球菌（Veillonella parvula）在120年前，当Veillon和Zuber将其从阑尾炎脓肿中分离出来时被发现并被描述。六十年后，同样的微生物被用于第一次观察外膜（OM），从而证明了革兰氏阴性和革兰氏阳性细胞包膜结构之间的关键区别。目前在包括口腔、肺、胃肠道和阴道内的人体多个生态位中发现了Veillonella parvula菌。Veillonella parvula可能在许多环境中发挥重要作用，但其主要生态位是作为口腔中的第二殖民者。
与口腔疾病
Veillonella是牙周炎的重要病原体，是舌苔中的本土口腔细菌，而且Veillonella附着在舌头上的能力很高，已被确定为硫化氢（H2S）的主要生产者，H2S是口腔恶臭的主要成分之一。并且在1份报告中，它是慢性上颌窦炎中最常见的厌氧性病原体。
口腔生物膜是一个多物种的社区，敌对双方共存，以保持社区成员的生态平衡。 在早期的口腔生物膜形成的各个阶段中，Veillonella作为早期定居物种可以与许多细菌形成聚集，包括最初的定居者戈登链球菌和牙周病原体Fusobacter nucleatum。 除了为许多微生物提供结合位点外，Veillonella还能为牙周病原体的生存和生长提供营养。 这些发现表明，Veillonella在口腔生物膜的发育和人类口腔生态学中起着重要的“架桥”作用。
Veillonella和链球菌在生态系统（如口腔和结肠）中发生代谢相互作用并经常共生，共存可能部分取决于它们在代谢中的相互作用的潜力。链球菌属参与糖的发酵，产生乳酸作为其主要发酵终产物。反过来，Veillonella也以利用乳酸作为碳和能源的能力而闻名。
全世界龋齿的患病率仍然很高。 当牙齿暴露于产酸微生物通过碳水化合物代谢产生的酸（如乳酸）环境下时，就会引发龋齿。 Veillonella是主要的口腔微生物之一，由于它们具有将乳酸转化为弱酸并从NO3产生NO2的能力，而NO2可以抑制链球菌的生长和代谢。因此，Veillonella被认为对预防龋齿有好处。但是Veillonella代谢乳酸的能力受口腔环境因素（即pH和乳酸）的调节。
与免疫相关
肠道是肠道菌群与粘膜免疫系统相互作用的关键部位。近年来，人们发现Veillonella对人类微生物组，感染和免疫发育的重要影响。研究发现Veillonella parvula是细胞因子和TLR2 / 6信号转导的有效诱导。链球菌与韦永氏菌的组合似乎可以抵消IL-12p70的产生，同时增强IL-8，IL-6，IL-10和TNF-α的反应。
Veillonella的存在与疾病缓解或疾病稳定相关。这些特定的细菌属可能是免疫检查点抑制剂的生物标志物。在单抗治疗的患者中，或许它们可能成为晚期胃癌的特异性生物标志物。
一项研究指出对免疫治疗有响应的患者体内，富含屎肠球菌（Enterococcus faecium），产气柯林斯菌（Collinsella aerofaciens），青春双岐杆菌（Bifidobacterium adolescentis），肺炎克雷伯菌（Klebsiella pneumonia），小韦荣球菌（Veillonella parvula）， Parabacteroides merdae, 乳酸杆菌（Lactobacillus species）和长双歧杆菌（B longum）8个菌种。
最近的数据表明，Veillonella parvula可能在儿童早期免疫系统发育中起到保护作用和帮助作用。对婴儿的流行病学研究表明，Veillonella parvula的存在与哮喘、毛细支气管炎负相关，在有哮喘风险的儿童中，肠道中相对丰富的细菌属Veillonella的相对丰度显著降低。
Prevotella 作为革兰氏阴性菌，产生 LPS 进而诱发炎症反应。与此同时，该菌代谢产生的丙酸盐可以发挥抗炎症的作用。产生相互矛盾的结论背后或许是由于肠道微环境以及菌群构成的不同所导致的。当在肠道中 Veillonella 与唾液链球菌菌株 1 共培养时可降低炎性细胞因子的产生，而与菌株 2 共培养时炎性细胞因子的产生比各自单独培养时显著增加。
链球菌 和Veillonella在肠道微生物群的高丰度和种内遗传多样性，可能是这些菌对由于食物摄入量变化引起的营养物利用率变化而引起的高种群动态的主要驱动因素。这些动态的种群可能会深刻影响当地宿主与微生物之间的相互作用，从而调节肠道的生理和免疫系统功能。
与运动耐力相关
当我们跑步速度较慢时，糖和脂肪可以充分氧化分解成二氧化碳和水，并提供能量。但是，高强度运动后往往会出现肌肉酸痛现象，这是因为运动超过了有氧运动强度，导致葡萄糖通过无氧呼吸在体内代谢产生了乳酸，乳酸堆积会引起局部肌肉酸痛。
体内堆积的乳酸一部分继续分解成丙酮酸，再进一步被分解为二氧化碳和水，一部分则进入肝脏，乳酸可以再次合成糖原，这个过程称为糖异生。
Scheiman及其同事发表在《自然医学》（Nature Medicine）上文章研究了肠道微生物组对精英跑步者运动表现的影响，并确定了属于Veillonella属的一种能增强性能的微生物。比赛结束后，马拉松长跑运动员中富集了非典型的Veillonella atypica菌种。Veillonella 利用乳酸作为碳源, 分析发现乳酸到丙酸的代谢通路的运动后运动员中富集。
图片来源：慧跑
与其他厌氧菌不同，Veillonella atypica具有通过三羧酸循环的乳酸代谢的完整途径。Veillonella细菌可以将乳酸变成丙酮酸，而且体内产生的乳酸可以穿过上皮屏障进入肠腔，也就是说运动中体内积累的乳酸可以运输到肠道，肠道中的veillonella细菌就可以分解乳酸了。
在这个过程中，会产生丙酸，而丙酸可以提高小鼠心率和氧气利用率，丙酸还可以促进人体的新陈代谢。为了验证丙酸是否可以改善运动性能，研究人员给一些小鼠使用丙酸灌肠。与喂食Veillonella atypica 菌株的小鼠相同，这些使用丙酸灌肠的小鼠的运动时间也明显增加了。科学家们还给小鼠注射了可以追踪的乳酸，发现这些乳酸会进入到肠道。 而且乳酸有助于这种微生物的生长。
总的来说，葡萄糖因肌肉运动产生乳酸，一部分乳酸通过血液循环进入肝脏，在肝脏中通过糖异生作用重新合成葡萄糖；一部分乳酸通过血液循环进入肠道，肠道中的Veillonella属细菌迅速将乳酸分解成丙酸，从而降低乳酸浓度，改善运动表现。
哺乳动物肠道微生物组可能会通过肌肉衍生的乳酸代谢为丙酸酯来为其宿主提供额外的跑步耐力能力提升。 此外，由于在多个独立的人体研究中，相对于久坐的控制者，经常运动者中的Veillonella菌增加了，这增加了这些微生物通过利用独特的代谢环境（L-乳酸代谢）而在运动员的肠道中具有适应性优势的可能性。 这可能会导致积极的反馈循环，从而以较小的能力加强锻炼。 换句话说，由于预期重复运动会导致肠道L-乳酸浓度增加，L-乳酸代谢物的代谢位扩大，因此，这些L-乳酸代谢物反过来有望提高运动的耐力。
与其他疾病
自闭症
最新的发表在CELL和谷禾健康2019年发表在GUT上的队列都表明，未来发展为自闭症谱系障碍的儿童早期肠道内Veillonella菌富集，比对照儿童显著增加。
原发性硬化性胆管炎
原发性硬化性胆管炎(PSC)是一种罕见的、以肝内外胆管受损为主要特征的原发疾病，易导致胆管炎症和肝纤维化的发生而原发性硬化性胆管炎。
PSC患者肠道菌群某些菌群丰富度也会产生相应变化。特别是韦荣球菌(Veillonella)、肠球菌(Enterococcus)和链球菌(Streptococcus)，其丰度显著升高。Veillonella可以通过肠道淋巴细胞进入肝脏。而肠球菌则是一种对万古霉素敏感的细菌，它可以通过分泌金属蛋白酶分解上皮钙黏蛋白破坏肠屏障。
肝病
在NAFLD和NASH中有几项研究确定，随着纤维化的进展，微生物群结构和功能恶化。晚期纤维化和NASH与碳水化合物和脂质代谢的变化有关，因为他们观察到相应功能的细菌含量增加。酒精性肝炎患者或肝脏疾病患者中Veillonella和Enterococcus丰度显著增加，而Veillonella parvula的丰度与白蛋白和血小板计数呈负相关。事实上，在所有3项肝硬化研究中，患者体内的几种Veillonella species的丰度都发生了改变。
肺癌
与对照组相比，肺癌患者的口腔菌群增加，特别是Streptococcus和Veillonella。口腔菌群的增加与PI3K和ERK上调有关。在体外实验中，气道上皮细胞暴露于Veillonella，Prevotella和Streptococcus也会导致ERK和PI3K通路上调(Tsay et al，2018)。PI3K通路被认为是肺癌发生的早期事件，因此共生微生物群失调会上调该通路促进肺癌发生。
胰腺癌
结果显示患有胰腺癌的病人组中三种口腔微生物Streptococcus，Treponema和Veillonella的组分显著低于其他组别。
其他
子痫前期患者会富集 Fusobacterium， Veillonella，Clostridum 等这些细菌。剖腹产的新生儿粪便微生物群富含Veillonella dispar/V这表明皮肤、口腔微生物以及出生过程中周围环境中的细菌是第一批在这些婴儿中定殖的细菌。
与对照组相比，后发展为T2D的研究对象Veillonella dispar的丰度较低，结果表明肠道菌群中的该物种可能与参与宿主血糖调节。
在肥胖的男性中观察到韦荣氏球菌属（Veillonella）和产甲烷短杆菌属（Methanobrevibacter）高于女性。 在吸烟人群中，Veillonella dispar的脂多糖生物合成通路相关的基因出现频率较高。
口腔，捏着呼吸道的脉搏，牙好胃口好，也不是句空话。Veillonella作为口腔和肠道的重要“居民”，它的定植，丰度以及与其他菌落共存的能力决定和影响着人体的口腔和消化道甚至肝肺胃疾病。
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主要参考文献：
Yu Sunakawa, et al. Genomic pathway of gut microbiome to predict efficacy of nivolumab in advanced gastric cancer: DELIVER trial (JACCRO GC-08). ASCO GI. Jan 15-17, 2021. ABSTRACT 161.
Jackson, M.A., Goodrich, J.K., Maxan, M.-E., Freedberg, D.E., Abrams, J.A., Poole, A.C., Sutter, J.L., Welter, D., Ley, R.E., Bell, J.T. et al. (2015) Proton pump inhibitors alter the composition of the gut microbiota. Gut, 65, 749-756.
Shi, Y.-C., Cai, S.-T., Tian, Y.-P., Zhao, H.-J., Zhang, Y.-B., Chen, J., Ren, R.-R., Luo, X., Peng, L.-H., Sun, G. et al. (2019) Effects of Proton Pump Inhibitors on the Gastrointestinal Microbiota in Gastroesophageal Reflux Disease. Genom Proteom Bioinform, 17, 52-63.
Bajaj, J.S., Acharya, C., Fagan, A., White, M.B., Gavis, E., Heuman, D.M., Hylemon, P.B., Fuchs, M., Puri, P., Schubert, M.L. et al. (2018) Proton Pump Inhibitor Initiation and Withdrawal affects Gut Microbiota and Readmission Risk in Cirrhosis. 113, 1177-1186.
Wang L, Yu X, Xu X, Ming J, Wang Z, Gao B, Xing Y, Zhou J, Fu J, Liu T, Liu X, Garstka MA, Wang X and Ji Q (2021) The Fecal Microbiota Is Already Altered in Normoglycemic Individuals Who Go on to Have Type 2 Diabetes. Front. Cell. Infect. Microbiol. 11:598672. doi: 10.3389/fcimb.2021.598672
Wong-Rolle A, Wei HK, Zhao C, Jin C. Unexpected guests in the tumor microenvironment: microbiome in cancer. Protein Cell. 2020 Dec 9. doi: 10.1007/s13238-020-00813-8. Epub ahead of print. PMID: 33296049.
Metagenomic analysis of bacterial species in tongue microbiome of current and never smokers 03-13, doi: 10.1038/s41522-020-0121-6
Scheiman J, Luber JM, Chavkin TA, MacDonald T, Tung A, Pham LD, Wibowo MC, Wurth RC, Punthambaker S, Tierney BT, Yang Z, Hattab MW, Avila-Pacheco J, Clish CB, Lessard S, Church GM, Kostic AD. Meta-omics analysis of elite athletes identifies a performance-enhancing microbe that functions via lactate metabolism. Nat Med. 2019 Jul;25(7):1104-1109. doi: 10.1038/s41591-019-0485-4. Epub 2019 Jun 24. PMID: 31235964; PMCID: PMC7368972.
Djais AA, Theodorea CF, Mashima I, Otomo M, Saitoh M, Nakazawa F. Identification and phylogenetic analysis of oral Veillonella species isolated from the saliva of Japanese children. F1000Res. 2019 May 3;8:616. doi: 10.12688/f1000research.18506.5. PMID: 31448103; PMCID: PMC6688723.
Mashima I, Theodorea CF, Djais AA, Kunihiro T, Kawamura Y, Otomo M, Saitoh M, Tamai R, Kiyoura Y. Veillonella nakazawae sp. nov., an anaerobic Gram-negative coccus isolated from the oral cavity of Japanese children. Int J Syst Evol Microbiol. 2021 Jan;71(1). doi: 10.1099/ijsem.0.004583. Epub 2020 Dec 2. PMID: 33263509.
Rovery C, Etienne A, Foucault C, Berger P, Brouqui P. Veillonella montpellierensis endocarditis. Emerg Infect Dis. 2005 Jul;11(7):1112-4. doi: 10.3201/eid1107.041361. PMID: 16022792; PMCID: PMC3371781.
Maqsood A. Bhatti, Michael O. Frank, Veillonella parvula Meningitis: Case Report and Review of Veillonella Infections, Clinical Infectious Diseases, Volume 31, Issue 3, September 2000, Pages 839–840, 0人
谷禾健康
微生物多样性测序（扩增子测序）是基于二代高通量测序对16S/18S/ITS等序列进行测序。可以同时检测样本中的优势物种、稀有物种及一些未知物种的检测，获得样本的微生物群落组成以及相对丰度。
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β多样性
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使用weighted_unifrac的PCoA组间分布及差异
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非度量多维尺度分析 NMDS 分析与 PCoA 类似，也是一种基于样本距离矩阵的分析方法，通过降维处理展现样本特定的距离分布。
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组间各物种分类水平及功能差异
Tukey检验
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整合文献原核功能数据库，偏向于代谢和生物学功能的注释。比较适合环境样本，比如说碳、氢、氧、氮、硫等元素的代谢循环的能力。
基因功能预测？——Picrust2功能预测分析
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2万多的物种，基因覆盖更完整
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组间各物种分类水平及功能差异
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