谷禾健康
Akkermansia muciniphila(AKK菌)因其独特的黏蛋白降解能力和与宿主健康的复杂关系,目前已成为微生物学和医学研究的前沿热点。谷禾此前已对该菌进行过系统性介绍。
肠道重要菌属——Akkermansia Muciniphila,它如何保护肠道健康
本文将继续深入探讨AKK菌的研究前沿。
2004年,当这株微小的厌氧菌首次从人类粪便中被分离出来时,没人预料到它会凭借独特的黏蛋白降解能力(当然目前又陆续发现了几个黏蛋白降解菌),在此后近二十年间掀起一波又一波的研究热潮。
更引人关注的是AKK菌呈现出耐人寻味的双面性:它既是下一代益生菌的希望之星,与代谢健康、长寿紧密相连;又在某些特定情境下显现出促进疾病的潜在风险。这种复杂的功能属性,正是当前科研亟待厘清的关键议题。
三篇发表于顶级期刊的AKK菌研究为该领域带来了重要突破:
这三篇文献从不同维度构建了迄今为止最为全面和深入的AKK菌研究图景,涵盖了其基本生物学特性、复杂的基因组结构与菌株多样性、与宿主免疫系统的精密互作机制,以及在不同疾病模型中呈现的矛盾表型,系统解析了这些现象背后的科学逻辑。
因此,本文谷禾整合了这三篇文献的核心观点,以科研从业者的视角带领大家深入解构AKK菌的研究进展。我们希望与各位共同探讨一个关键问题:如何理性认知并合理应用AKK菌这个双面细菌,从而真正实现精准调控肠道健康的目标。
嗜黏蛋白阿克曼氏菌(Akkermansia muciniphila),简称为AKK菌,属于疣微菌门。这个名字是为了纪念荷兰微生物生态学家Antoon Akkermans博士,而“muciniphila”则源自拉丁语,意为偏爱黏蛋白。
注:Antoon Akkermans:荷兰瓦赫宁根大学(Wageningen University)微生物生态学家,对土壤和肠道微生物研究有重要贡献。
AKK菌的发现和命名具有里程碑意义
2004年,仅使用黏蛋白(mucin)作为唯一的碳源和氮源进行富集培养了该菌。AKK菌具备独特的酶系统,能够降解并利用黏蛋白作为其生存和生长的主要能量来源,这种自给自足的能力使其在竞争激烈的肠道环境中占据了稳定的一席之地。
其模式菌株为Akkermansia muciniphila MucT(亦写作Muc5),拥有多个菌株编号,如ATCC BAA-835、DSM 22959等,是目前研究中应用最广泛的菌株。
生态位
AKK菌在人体肠道中占据着一个非凡的生态位——肠道黏液层。这一层由宿主杯状细胞分泌的黏蛋白糖蛋白构成,是隔开肠道上皮细胞与肠腔内大量微生物的第一道物理和化学屏障。
从分布来看,AKK菌不仅存在于人类肠道,也广泛栖息于包括小鼠、牛、猪、兔等多种脊椎动物的胃肠道。
形态与基本特性
在显微镜下,AKK菌呈现为一种椭圆形、不运动、不产芽孢的革兰氏阴性严格厌氧菌。
AKK菌并非绝对厌氧
研究发现,在只有微量氧气的环境中,它不仅能存活,甚至可能生长得更好。这主要得益于其基因组编码的细胞色素 bd 氧化酶复合物等耐氧机制。
也正因为具备这种有限耐氧能力,AKK菌才能适应并定植于结肠黏液层——这里处在厌氧的肠腔与相对更富氧的上皮细胞之间,存在明显的氧梯度。
结构特征,驱动互作
AKK菌约2.66Mb的基因组,是其特殊生活方式的说明书。其中最引人注目的,就是黏蛋白利用基因簇(Mucin Utilization Loci, MULs)。
黏蛋白转运系统:把食物带回家再吃的策略
Grant等人的研究指出,这些基因编码了一套精密的黏蛋白转运系统,能将黏蛋白大分子吞入菌体内部一个叫黏蛋白体的特殊结构中进行降解。这种偏自私的代谢策略,有点像把食物带回家再吃,从而最大限度地减少了与肠道中其他微生物的营养竞争,进而巩固自身的生存优势。
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此外,它的细胞表面也布满了武器。电镜观察到的菌毛样结构,特别是重要的外膜蛋白Amuc_1100,不仅参与黏附,更是与宿主免疫系统直接对话的关键分子。
其细胞壁的肽聚糖层含有非乙酰化的葡糖胺残基,这在革兰氏阴性菌中相当罕见,使其能被宿主的NOD1和NOD2受体识别,从而触发免疫应答。这些独特的结构,都为它与宿主之间复杂的相互作用埋下了伏笔。
生态分布:影响因素和趋势
AKK菌在人群中的分布呈现出鲜明的特征
根据人类肠道微生物组图谱对来自20个国家3268名健康人的数据分析,AKK菌在约40.3%的健康供体中被检测到,平均相对丰度为1.24%。这个数字看似不高,但其分布的倾向性却极具信息量。
AKK菌的分布图谱
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Grant et al., Nature Microbiology
a) 在健康人群中,其丰度和患病率存在地理和性别差异。
b) 在不同疾病状态下,其丰度呈现显著变化,例如在IBD中减少,而在帕金森病中富集。
c) 其相对丰度随生命周期动态变化,在百岁老人中再次出现高峰。
d) 进化树揭示了AKK菌属内部复杂的系统发育关系。
从图1中我们可以清晰地看到:
-地域与生活方式
工业化人群中的丰度更高,这暗示着饮食或生活方式可能是其丰度的重要调节因素。
-年龄
AKK菌在婴儿期迅速定植,成年后逐渐下降,但在百岁老人中却意外地再次富集,被认为是健康长寿的潜在标志物。Luo等人的文章也系统总结了这一现象,指出AKK菌在人类中的年龄依赖性定植模式与在小鼠中的模式恰好相反,这提醒我们在选择动物模型时需格外谨慎。
-疾病状态
这是最能体现其双面性的一点。在炎症性肠病(IBD)患者中,AKK菌丰度显著降低(UC患者中为9.9%,克罗恩病患者中为14.3%);然而,在帕金森病(90.3%)、某些癌症(如黑色素瘤,65.9%)和动脉粥样硬化(83.3%)患者中,其丰度却异常增高。这种看似矛盾的分布模式,强烈暗示AKK菌的角色并非简单的好或坏,而是深度依赖于宿主的病理生理背景。
Tips:看到这些分布数据,首先想到的不是简单的因果关系,而是一个复杂的生态反馈回路。例如,在IBD中,AKK菌的减少可能是肠道炎症环境恶化、黏液层破坏的结果,而非原因。反之,在帕金森病中,其增多也可能是一种代偿性反应,或是神经退行性疾病引发的肠道环境改变所致。将AKK菌丰度作为疾病的生物标志物时,我们必须高度审慎,通过系统证据加以判别:该因素究竟是事件升级的关键驱动(促进因素),是对事态的响应性干预(缓解因素),还是与结果无显著因果关联的伴随出现(旁观变量)。
所以构建真实世界的特定疾病样本人群数据才能更有助于解析复杂的肠道微生态,类似的菌还有如活泼瘤胃球菌和普雷沃氏菌等相互矛盾的研究。
三篇文献都不约而同地强调了菌株水平多样性的重要性。
长久以来,大多数研究都围绕着模式菌株MucT(ATCC BAA-835)展开。然而,随着基因组学技术的发展,AKK菌家族的内部复杂性逐渐浮出水面。基于全基因组测序,研究人员已将AKK菌划分为至少四个系统发育群(phylogroups, AmI-AmIV)。
这些不同发育群的菌株虽然16S rRNA基因序列高度相似(>;99%),但其全基因组的平均核苷酸同一性(ANI)却可能低于95%,这已经达到了物种划分的界限。这意味着,我们过去所称的“A. muciniphila”很可能是一个包含多个物种或亚种的复合体。这种基因组上的差异,直接导致了功能上的多样性:
代谢能力差异
Loannou等人提到,AmII发育群的菌株拥有合成维生素B12的能力,而AmI发育群则不具备,这直接影响了它们的代谢产物谱。不同菌株对人类母乳寡糖(HMOs)的利用效率也存在显著差异。
对宿主影响的差异
在DSS诱导的结肠炎小鼠模型中,研究人员发现不同的人源AKK菌株对肠道炎症的影响截然不同:一个菌株表现出保护作用,两个菌株没有效果,而第四个菌株甚至有加剧炎症的趋势。这为我们敲响了警钟:随意使用一种AKK菌株来治疗IBD,可能不仅无效,甚至有害。
抗生素抗性差异
模式菌株MucT携带多种抗生素抗性基因(如blaA, dfrA, sul, tetM, van)。但从健康人中分离的菌株,其抗性谱各不相同。考虑到AKK菌具有通过水平基因转移获取新基因的能力,将一个未经充分安全性评估的活菌株作为益生菌推向市场,存在传播抗生素抗性的潜在风险。
对于产业界而言,开发AKK菌产品时,可能要对菌株进行全面的功能和安全性评估(包括代谢能力、免疫调节特性、抗生素抗性谱、基因转移能力等)是不可或缺的关键步骤。
AKK菌能在竞争激烈的肠道环境中占据一席之地,并与宿主展开如此复杂的对话,其背后是一套精妙的分子机制。这不仅是它生存的智慧,也是我们理解其双面性的钥匙。
黏蛋白降解
AKK菌对黏蛋白的降解,远非简单的啃食。它拥有一整套工具箱——即种类繁多的碳水化合物活性酶(CAZymes)。这个过程极具策略性:
-外层突破
首先,通过表面的唾液酸酶和岩藻糖苷酶,切除黏蛋白聚糖链最外层的唾液酸和岩藻糖残基。
-核心瓦解
接着,动用半乳糖苷酶、己糖胺酶和硫酸酯酶等,逐步分解聚糖核心结构。
-内部消化
降解产物通过糖转运系统高效内化。AKK菌虽不具备拟杆菌式的典型PULs/MULs基因簇,但其膜转运蛋白能有效摄取降解后的单糖和寡糖,进行发酵,最终产生乙酸、丙酸等短链脂肪酸(SCFAs)。
注:
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其中,丙酸的产生尤为重要。它不仅是其他肠道菌的能量来源,还能通过激活G蛋白偶联受体GPR41和GPR43,刺激肠道L细胞分泌胰高血糖素样肽-1(GLP-1),从而参与调节宿主的血糖稳态和食欲。这部分解释了AKK菌在代谢性疾病中的有益作用。
与免疫系统的多渠道对话
AKK菌与宿主免疫系统的互作,是一场多层次、多渠道的复杂对话。Grant等人的文章中这个信息量大的图,为我们生动地展示了这一过程。
AKK菌与宿主结肠黏膜的相互作用机制示意图
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Grant et al., Nature Microbiology
有几个关键的互作途径:
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图源:doi.org/10.1038/s41579-024-01106-1
AKK菌并非孤立地存在于肠道中,而是作为复杂微生物网络的一部分,与其他细菌、古菌甚至病毒发生着密切的相互作用。这些相互作用包括协同合作、竞争排斥和营养交换(交叉喂养),共同决定了肠道微生态的结构、功能以及对宿主健康的影响。
交叉喂养:生态系统中的资源分享者
尽管AKK菌被描述为自私的黏蛋白降解者,因为它倾向于将黏蛋白内化代谢,但这一过程实际上为其他微生物创造了丰富的资源。
为产丁酸菌提供底物
AKK菌降解黏蛋白释放的单糖(如岩藻糖)和产生的代谢产物(如乙酸盐、丙酸盐),可以被许多重要的产丁酸菌利用。
例如,在共培养实验中,AKK菌能支持产丁酸菌如Anaerostipes caccae、Anaerobutyricum hallii、Faecalibacterium prausnitzii、Roseburia等细菌的生长,并促进有益代谢物丁酸盐的产生。丁酸盐是结肠上皮细胞的主要能源,具有强大的抗炎和维持肠道屏障完整性的功能。
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图源:doi.org/10.1038/s41579-024-01106-1
双向营养交换
AKK菌与其他细菌的相互作用可以是双向的。例如,它与A. hallii之间存在互惠共生关系:AKK菌为A. hallii提供黏蛋白降解产物和乙酸用于丁酸合成,而A. hallii产生的丁酸等代谢物有助于维持适宜AKK菌生长的肠道微环境。
某些研究还提示可能存在更直接的代谢物交换,如维生素或辅因子的共享,但具体机制仍在探索中。
协同作用:共同抵御疾病
A. muciniphila 可能需要其他微生物的存在来预防某些疾病。
1+1>2:微生物协同互作的抗病潜力
例如,在结直肠癌(CRC)小鼠模型 Apc 突变小鼠中,单独定植 A. muciniphila 或幽门螺杆菌导致肿瘤负担增加,而两者共定植则减少了肠道肿瘤数量。
A. muciniphila Muc 和狄氏副拟杆菌(Parabacteroides distasonis)表现出协同的抗结肠炎关系。
在癫痫 Kcna1⁻/⁻ 小鼠中,A. muciniphila Muc和 狄氏副拟杆菌的联合给药通过降低细菌交叉代谢产生的γ-谷氨酰转肽酶活性,在控制饮食条件下预防了癫痫发作。
这些发现强调了一个核心观点:微生物之间的相互作用网络,比单一菌株的存在与否更能决定疾病的结局。
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图源:doi.org/10.1038/s41579-024-01106-1
不单单是AKK菌,而应评估菌群的整体效应
这种复杂的互作关系提示我们在应用层面需要更宏观的视野。
通过菌株脱除试验发现, A. muciniphila 的引入,与抗炎共生菌普拉梭菌(F. prausnitzii)丰度降低相关(在疾病诱导之前),对柠檬酸杆菌(C. rodentium)感染的易感性部分归因于这种细菌网络的变化。这意味着,即使 AKK 菌无法长期定植,它作为过客仍可能重塑肠道菌群的功能结构。
因此,未来评估益生菌应用时,不能仅盯着 AKK 菌本身,而应将其视为生态系统的一个扰动因子,充分重视个体间菌群基线的差异,深入评估其对肠道微生态结构和功能的长期重塑作用,以及宿主原有菌群对其行为的反向调控。
竞争与拮抗
在肠道有限的生态位中,竞争是不可避免的。
与黏液降解菌的竞争
在以MUC2为唯一碳源的体外共培养体系中,当AKK菌与其他的黏液降解菌如普通拟杆菌(Bacteroides vulgatus)、活泼瘤胃球菌(Ruminococcus gnavus)等一起培养时,AKK菌的生长会受到抑制,而其他细菌的生长则被促进。这表明在黏液降解这一功能上存在激烈的竞争。
对其他菌群的负向影响
在某些情况下,AKK菌的存在可能对其他有益菌产生负面影响。
例如,在一个定义的微生物群落中,AKK菌的存在与抗炎共生菌Faecalibacterium prausnitzii丰度的降低相关。但这种相关性并不一定代表因果关系——可能是:环境条件改变导致两者同时变化,或其他因素的间接影响特定疾病状态的反映(如炎症性肠病)。
与普雷沃氏菌的负相关
在人类肠型(enterotype)研究中,AKK菌通常在以Ruminococcus属为主的肠型中富集,而与以普雷沃氏菌为主的肠型呈负相关,这反映的是菌群组成的自然差异,不同肠型由遗传、饮食、地理位置等多因素决定,不是AKK菌排斥普雷沃氏菌,而是不同的生态位和代谢特征。
目前最核心、也最令人困惑的部分:AKK菌在不同疾病背景下的双面角色。三篇文献都花费了大量篇幅,尽力为我们揭示了这种环境依赖性。
AKK菌与结肠炎:保护、致病与宿主互作的复杂博弈
关于AKK菌与结肠炎的关系,研究结论充满了矛盾。
保护作用
在常规的DSS化学诱导结肠炎模型中,灌胃AKK菌或其蛋白Amuc_1100,通常能观察到保护效果。其机制包括上调紧密连接蛋白(如ZO-1、Occludin)以修复屏障、减轻内质网应激、促进Treg细胞应答等。Luo等人的综述也证实,活菌能够增加紧密连接蛋白的表达。
致病作用
然而,一旦宿主背景改变,情况就可能逆转。在遗传易感的Il10-/-小鼠(一种自发性结肠炎模型)中,单独定植AKK菌反而会加剧炎症,导致黏液层变薄和促炎细胞因子上调。这表明,在宿主免疫调节能力受损(如缺乏关键的抗炎因子IL-10)的情况下,AKK菌的黏蛋白降解活性可能弊大于利。
宿主蛋白的策反
Grant等人的研究揭示了一个更为精妙的机制。在溃疡性结肠炎患者中,一种名为Intelectin-1(ITLN1)的宿主蛋白会过度表达。这种蛋白会特异性地结合AKK菌,将其拉到更靠近上皮细胞的位置。这种亲密接触在炎症背景下,反而加剧了免疫反应和组织损伤。
感染:启动防御,还是放大风险?
在面对外来病原体入侵时,AKK菌的角色同样摇摆不定。
有益面:抗感染
AKK菌的某些组分或代谢物显示出抗感染的潜力。例如,其产生的三肽RKH能通过阻断TLR4信号通路,保护小鼠免于致死性脓毒症。Amuc_1100蛋白则能预防沙门氏菌引起的肝损伤。
有害面:缺膳食纤维就吃粘液层,病原体侵入
AKK菌的关键功能——降解黏蛋白,在特定条件下会为病原体开门。
在一项设计精巧的无菌小鼠实验中,研究者发现,缺乏膳食纤维的饮食会导致肠道中的AKK菌饥不择食,转而大量消耗黏液层。这层被削弱的物理屏障,使得致病菌Citrobacter rodentium能够轻易入侵,导致致命感染。
更具说服力的是,当研究者从这个菌群中移除AKK菌后,即使在无纤维饮食下,小鼠也能免于感染。这证明了AKK菌在这种情境下的内鬼角色。有趣的是,一旦恢复富含纤维的饮食,AKK菌的存在反而与较低的病原体载量相关,显示出保护作用。
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Tips:同一种菌,两副面孔:有膳食纤维时,AKK菌是肠道卫士;没有纤维时,它却会啃食肠道黏膜。这个营养开关,让它在天使与魔鬼之间切换。这个发现具有极其重要的实践意义。告诉我们,补充AKK菌益生菌的同时,如果忽略了饮食管理(特别是保证充足的膳食纤维摄入),可能不仅无法获益,甚至可能损害肠道屏障,增加感染风险。这为精准营养与精准菌群干预的结合提供了强有力的理论依据。
癌症:抗肿瘤反应与促肿瘤微环境的动态博弈
在癌症领域,尤其是结直肠癌,AKK菌的形象同样复杂。
促癌风险
部分研究在结直肠癌患者的肿瘤组织和相应的小鼠模型中,都观察到了AKK菌的富集。有观点认为,它通过降解黏液屏障,可能为肿瘤的发生发展创造了条件。
抑癌潜力
然而,另一些研究则得出了相反的结论。AKK菌的EVs、乙酰转移酶Amuc_2172等组分,在小鼠模型中显示出抑制肿瘤生长的效果。
在免疫治疗中的助攻
AKK菌在癌症研究中最高光的时刻,莫过于其在免疫检查点抑制剂(如PD-1抗体)治疗中的作用。
多项研究一致发现,对PD-1治疗有反应的癌症患者(包括肺癌、肾癌等),其肠道中AKK菌的基线水平显著更高。更关键的是,在小鼠模型中,将无反应者粪菌移植给小鼠后,再补充AKK菌,能够重新恢复小鼠对PD-1治疗的敏感性。这表明AKK菌可能通过调节全身免疫状态,增强了抗肿瘤免疫应答,从而成为免疫治疗的增效剂。
代谢与神经系统疾病:更偏向有益的角色
相较于在炎症和感染中的摇摆不定,AKK菌在代谢性疾病中的有益作用,是目前证据最为一致、也最具转化潜力的领域。无论是动物模型还是初步的人体研究,补充活菌或巴氏杀菌的AKK菌,都被证明能够改善胰岛素敏感性、降低胆固醇、减少脂肪堆积。其机制与促进GLP-1分泌、调节脂肪酸代谢、减轻低度炎症等密切相关。
在神经系统疾病中,AKK菌的关联性再次变得复杂。它在帕金森病和多发性硬化症患者中常常富集,体外实验也显示它可能诱导α-突触核蛋白聚集或促炎反应。然而,也有研究将多发性硬化症患者中AKK菌的增多与较低的残疾程度联系起来,提示这可能是一种有益的代偿反应。这种矛盾性再次凸显了菌株差异和宿主背景的重要性。
面对AKK菌如此复杂,我们该如何从科学研究走向临床应用?有幸的是三篇文献为我们提供了一些思考和前瞻性的指导。
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Grant et al., Nature Microbiology
影响AKK菌双重性的因素及潜在治疗策略。AKK菌的最终效应受到菌株差异、饮食、微生物互作和宿主状态的共同调节。理解这些变量,有助于我们选择最优的治疗应用方案,例如是使用活菌、灭活菌,还是分离的生物活性组分。
精准应用的策略选择
未来的AKK菌疗法,绝非一招鲜,吃遍天,而应是量体裁衣的精准策略。
活菌 vs. 灭活菌
巴氏杀菌的AKK菌是一个极具吸引力的选择。它在欧盟已被批准为新食品原料,安全性更高,避免了活菌定植和基因转移的风险。
多项研究证实,灭活菌依然保留了大部分有益的代谢调节功能,这可能归功于其热稳定的细胞壁成分(如Amuc_1100)。
整体 vs. 组分
直接使用分离的生物活性组分,是更为精准和安全的策略。例如,将Amuc_1100蛋白作为药物开发,或利用其EVs作为治疗载体。
Ioannou 等人的综述强调了 AKK 菌作为“酶学底盘”的巨大潜力。例如利用AKK菌的糖苷酶来改造血细胞表面的ABO血型抗原,展示了从基础研究到生物技术应用的转化潜力。
补充 vs. 内源调节
除了直接补充AKK菌,通过饮食干预(如补充富含多酚的食物、膳食纤维)来扶持宿主内源AKK菌的生长,也是一种温和而有效的方法。
关 键 挑 战
要把 AKK从研究热点真正推进到可精准应用的干预手段,还需要把菌群检测作为贯穿研发—临床—产业化全链条的基础设施,融入以下关键环节:
菌株筛选与鉴定
建立一个标准化的 AKK 菌株功能评价体系,涵盖其代谢谱、免疫调节能力、安全性等多个维度,是实现精准应用的前提。与此同时,需要配套规范化的菌群检测(如 16S/宏基因组与定量检测),用于界定不同菌株在不同微生态背景中的适配性与可重复性,避免同名不同效。
情境依赖性的机制阐明
需要更深入地研究,在不同宿主遗传背景、饮食模式和共存微生物群落的影响下,AKK 菌的功能会发生怎样的改变。这需要更复杂的动物模型(如人源化小鼠模型)和多组学技术的结合;其中,纵向菌群检测是识别“谁在场、谁在协同/拮抗、何时发生生态位迁移”的关键手段,也是将机制与真实个体差异对齐的必要条件。
安全性评估
必须对活菌制剂的抗生素抗性传播风险进行严格评估。开发不含抗性基因的工程菌株,或优先使用灭活菌及组分,是未来的方向。同时,应将菌群检测用于追踪干预后菌群结构扰动、耐药基因负荷变化以及潜在机会致病菌扩增等风险信号,实现从前期评估到使用中/使用后监测的闭环。
递送与生产工艺
作为严格厌氧菌,如何实现 AKK 菌的大规模、低成本培养,并开发出能保护其在通过胃肠道时保持活性的口服制剂,是产业化面临的技术瓶颈。
在这一过程中,菌群检测同样不可或缺:一方面用于生产端的质量控制(纯度、污染菌与批间一致性),另一方面用于应用端的效果评估与分层(基线菌群与 AKK 定植/丰度变化、关键功能菌群响应),从而把工艺参数—活性保持—体内生态学结果真正连接起来,提升可复制性与可监管性。
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图源:doi.org/10.1038/s41579-024-01106-1
通过对这三篇力作的梳理,我们对Akkermansia muciniphila的认知,从一个模糊的有益菌形象,变得立体、丰满,也更加敬畏。它不再是一个简单的标签,而是一个充满动态和变数的生命体。
毒理学有一句名言:剂量决定毒性。在微生物学领域,我们或许可以引申为:情境决定属性。对于AKK菌而言,这个情境包含了我们吃下的每一口食物,我们基因中编码的每一个蛋白,以及我们肠道中与之共存的亿万菌群。
作为科研和从业工作者,我们的核心任务在于阐明这些情境依赖性效应的内在机制。未来研究需要超越简单的相关性分析,通过严谨的实验设计和先进的技术手段,明确AKK菌发挥特定生物学效应的必要条件、充分条件及其剂量-效应关系,解析宿主遗传背景、肠道微生态结构、代谢状态等因素对其功能的调控作用等。
探索之路,道阻且长,但充满希望。与各位同仁共勉。
主要参考文献
Grant ET, Monzel E, Desai MS. Navigating the duality of Akkermansia muciniphila. Nat Microbiol. 2026 Jan;11(1):20-30.
Ioannou A, Berkhout MD, Geerlings SY, Belzer C. Akkermansia muciniphila: biology, microbial ecology, host interactions and therapeutic potential. Nat Rev Microbiol. 2025 Mar;23(3):162-177.
Luo Y, Lan C, Li H, Ouyang Q, Kong F, Wu A, Ren Z, Tian G, Cai J, Yu B, He J, Wright AG. Rational consideration of Akkermansia muciniphila targeting intestinal health: advantages and challenges. NPJ Biofilms Microbiomes. 2022 Oct 17;8(1):81.
谷禾健康
普通拟杆菌(Bacteroides vulgatus/Phocaeicola vulgatus)是人类结肠中最常见的革兰阴性厌氧杆菌之一,在超过90%的人群中都能够检出。其属于拟杆菌属(Bacteroides),是肠道“核心菌”,既有益生潜力,也在某些条件下与疾病相关。
它具有大量多糖利用位点(PULs),能降解膳食多糖和黏液糖蛋白,产生短链脂肪酸(如乙酸、丙酸、丁酸)和琥珀酸等有机酸。基因组学显示其具有丰富的碳水化合物转运与代谢系统。研究发现,其会产生一种叫做泛酸盐(维生素B5)的物质,影响肠道中的GLP-1和肝脏的FGF21的释放,这两种激素会影响葡萄糖代谢并具有神经保护特性。
B.vulgatus产生的代谢物(如N-乙酰氨基葡萄糖)可以促进另一个肠道有益细菌Akkermansia muciniphila(简称Akk菌)的生长。在高脂饮食导致Akk菌数量减少的情况下,B.vulgatus的施用可以恢复其丰度。
研究发现,普通拟杆菌(B.vulgatus)在肥胖、心血管疾病、2型糖尿病、肠道炎症、内皮功能障碍患者中丰度降低;而在自闭症和甲状腺炎患者中发现其丰度升高。
总的来说,普通拟杆菌(Bacteroides vulgatus) 算是一种有益的肠道共生菌,但其效果依赖于特定菌株的水平特异性。其在心血管代谢病、糖尿病、骨质疏松、结肠炎及感染防御等领域中显示出显著的保护潜力,同时在特定菌株或蛋白酶过度表达、黏膜屏障破坏时又可参与炎症和严重感染。临床应用需基于明确的安全性和作用机制的精准菌株,而不是泛指“B.vulgatus”补充。
普通拟杆菌(Bacteroides vulgatus/Phocaeicola vulgatus)是一种厌氧、革兰氏阴性杆菌。它是人类肠道微生物组中最常见的细菌之一,该菌不仅对维持肠道健康至关重要,还具备多种益生潜力,并与多种疾病(如炎症性肠病和心血管疾病)相关。
分类信息
门:拟杆菌门
纲:拟杆菌纲
目:拟杆菌目
科:拟杆菌科
属:拟杆菌属
物种:普通拟杆菌(Bacteroides vulgatus)
普通拟杆菌(Bacteroides vulgatus)属于拟杆菌门(Bacteroidota)、是Bacteroides/Phocaeicola 属的重要种。
普通拟杆菌(Bacteroides vulgatus)又称Phocaeicola vulgatus,2019年起基于全基因组系统发育分析的研究将若干原属 Bacteroides 的物种重划入新属或其它属,Phocaeicola 作为新属或被恢复的属用于容纳包括 Bacteroides vulgatus 在内的若干物种。
形态与生理
细胞形态:Bacteroides vulgatus为杆状菌,专性厌氧,且不具芽胞形成能力。
抗原性:该菌有多个抗原类型,可能影响其致病性和免疫应答。
• 重要结构与分子特征
脂多糖(LPS):其LPS为低酰化、低磷酸化结构,以四、五酰型为主,与大肠杆菌六酰型脂多糖相比,引发更弱的TLR4促炎反应,具有明显免疫调节/低炎性特征。
蛋白酶与其他酶:具多种蛋白酶和糖苷水解酶,如 GH123 家族的 N-乙酰-β-半乳糖胺苷酶,参与黏膜糖链利用;部分菌株分泌的蛋白酶与溃疡性结肠炎严重度相关。
生态位
Bacteroides vulgatus是人类肠道的常驻共生菌,主要栖息在结肠中,谷禾数据库中显示其人群检出率高达98%。并能通过分解复杂的植物碳水化合物和膳食纤维来产生短链脂肪酸等代谢物。
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代谢能力
Bacteroides vulgatus具有大量多糖利用位点(PULs),能降解膳食多糖和黏液糖蛋白,产生短链脂肪酸(如乙酸、丙酸、丁酸)和琥珀酸等有机酸。基因组学显示其具有丰富的碳水化合物转运与代谢系统。
研究还发现,它会产生一种叫做泛酸盐(维生素B5)的物质,帮助身体释放两种重要的激素。肠道中的GLP-1和肝脏的FGF21,这些激素会调节对糖分的渴望。
耐药性
Bacteroides vulgatus通常对广泛使用的抗生素(如青霉素、头孢菌素和氨基糖苷类)耐药,但对甲硝唑、碳青霉烯类以及某些β-内酰胺和β-内酰胺酶抑制剂仍然敏感。其耐药性可能因感染部位而异。
与其他菌的相互作用
• 促进Akk菌的生长
韩国一项双胞胎队列(n=582)研究表明,B.vulgatus可以促进另一个肠道有益细菌Akkermansia muciniphila(简称Akk菌)的生长。
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研究发现,B.vulgatus通过代谢物的产生,尤其是在黏蛋白降解过程中,促进了Akkermansia muciniphila的丰度。B.vulgatus产生的代谢物(如N-乙酰氨基葡萄糖)对Akk菌的生长至关重要。在高脂饮食导致Akk菌数量减少的情况下,B.vulgatus的施用可以恢复其丰度。
噬菌体互作:被温和噬菌体感染后,可通过抑制感受蛋白 TspO 改变转录组并抑制胆汁酸脱缀合,进而影响宿主胆汁酸信号与表型。
与其他菌的互作:
增强:
Akkermansia muciniphila;
Bacteroidales;
Bacteroides;
Odoribacter;
Peptococcaceae.
抑制:
Bifidobacterium
Coriobacteriales
Adlercreutzia
Collinsella
Porphyromonas
Prevotella
Clostridium
Clostridiales incertae sedis
Clostridiales Family XIII. Incertae Sedis
Blautia
Coprococcus
Dorea
Lachnospiraceae
Ruminococcaceae
Ruminococcus
Dialister
Campylobacteraceae
Erysipelotrichaceae
普通拟杆菌(Bacteroides vulgatus)是人类肠道微生物组中一种重要的厌氧细菌,对维持整体健康至关重要。作为常驻菌群的成员,它参与多种关键生理功能,包括营养物质的代谢、维持肠道微环境的平衡,以及通过产生短链脂肪酸来支持肠道黏膜的完整性。
此外,B.vulgatus还能调节免疫反应,有助于抗炎效应,从而帮助防止各种疾病的发生。这种细菌的健康益处不仅限于肠道,研究表明它与心血管健康、代谢平衡及免疫系统的良好运作密切相关。
1
改善血糖控制并减少糖分渴望
2025年1月,江南大学研究团队在《Nature Microbiology》(IF:20.5)发表重要研究成果:游离脂肪酸受体4(Ffar4)通过肠道菌群调控糖类偏好的分子机制。
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• B.vulgatus丰度下降减少GLP-1的分泌
研究表明,Ffar4表达下调与高糖饮食行为相关,其缺失会导致肠道普通拟杆菌(Bacteroides vulgatus)丰度降低及代谢产物泛酸盐(维生素B5)减少。泛酸盐通过促进GLP-1分泌,激活肝脏FGF21释放,进而作用于下丘脑神经环路,抑制糖类摄入欲望并调节能量代谢平衡。该发现揭示了全新的肠-肝-脑轴调控网络,为代谢性疾病的干预提供了潜在治疗靶点。
GLP-1通过让身体在需要时释放胰岛素,减缓食物离开胃的速度,帮助身体。这能保持血糖稳定,帮助控制食欲。FGF21是另一种激素,能增强身体对胰岛素的敏感度,帮助你燃烧更多能量,并减少对含糖食物的渴望。它们共同创造了一个强大的系统,帮助保持新陈代谢和大脑的正常运作。
2
帮助恢复Akk菌,减轻肥胖
刚才前文就有提到,B.vulgatus通过产生的代谢物(如N-乙酰氨基葡萄糖),促进了Akkermansia muciniphila的丰度。
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You HJ,et al.Gastroenterology.2023
• 改善了Akk菌的耗竭,减轻了肥胖体重
研究发现,Bacteroides vulgatus 与 Akkermansia muciniphila 在瘦受试者(BMI<25)中存在互作关系,但在肥胖群体(BMI≥25)中这种互作消失。补充普通拟杆菌(Bacteroides vulgatus SNUG 40005)显著改善了高脂饮食小鼠的肥胖、胰岛素抵抗和肠道通透性,并通过产生代谢物N-乙酰葡萄糖胺提升了肥胖小鼠中Akkermansia的丰度。
研究者从健康成年人肠道中分离出 Bacteroides vulgatus SNUG40005,并将其灌胃给高脂饮食的肥胖小鼠,结果发现该菌株能显著降低小鼠体重、改善糖耐量并减少血液中脂多糖水平。
// 结论
综合以上结果,Bacteroides vulgatus 通过调节肠道微生物的相互作用,特别是促进Akkermansia muciniphila 的生长,可能对肥胖和代谢健康产生积极影响。这些发现为发展新型治疗方法提供了依据,尤其在管理肥胖和相关代谢疾病方面。
3
抑制动脉粥样硬化
冠状动脉疾病(CAD)患者的肠道微生物谱分析显示,与无冠状动脉风险因素的对照组相比,Bacteroides vulgatus和Bacteroides dorei的丰度显著降低。证实Bacteroides vulgatus和Bacteroides dorei通过降低血液内毒素水平改善动脉粥样硬化小鼠体的症状。
• B.vulgatus与脂多糖水平负相关,影响心血管健康
并且在CAD患者中,B.vulgatus和B.dorei的丰度与粪便脂多糖水平呈负相关,暗示这两种细菌可能通过调控脂多糖的产生来影响动脉粥样硬化的进展。
总之,Bacteroides vulgatus 在调节肠道微生物群、抑制炎症反应及维护心血管健康方面发挥着重要作用。进一步的研究可能帮助开发基于微生物群的策略,用于防治心血管疾病。
4
改善脂质代谢并调节高血脂
Bacteroides vulgatus Bv46 是一种常见的肠道细菌,其在高脂血症(高血脂)中的潜在健康效益受到研究。该研究通过高脂饮食诱导大鼠模型,评估了B.vulgatus Bv46 的补充对体重、脂质代谢、炎症标志物及肝脏病理的影响。
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• 关键发现:
改善脂质代谢:补充B.vulgatus Bv46 显著降低了高脂饮食大鼠的体重增加、食物效率以及肝脏指数,改善了血清脂质状况,包括降低总胆固醇(TC)、甘油三酯(TG)和低密度脂蛋白胆固醇(LDL-C),并提高了高密度脂蛋白胆固醇(HDL-C)的水平。
调节炎症反应:补充后,血清中的促炎细胞因子(如 IL-1β、IL-6 和 TNF-α)显著降低,表明B.vulgatus Bv46 能够减轻全身炎症反应。
肠道微生物的改变:该菌株的补充导致肠道微生物群落组成的显著变化,主要表现为Firmicutes与Bacteroidetes 的比率降低,Bacteroides 和 Parabacteroides 属的丰度增加,这种变化与健康个体的微生物群落特征相似。
短链脂肪酸的产生:补充B.vulgatus Bv46促进了肠道内短链脂肪酸(SCFAs),特别是丙酸和丁酸的产生,这些代谢产物对抗炎和代谢健康具有重要作用。
胆汁酸代谢:研究发现,B.vulgatus Bv46 产生的胆盐水解酶(BSH)有助于胆汁酸的去结合,促进了胆汁酸的转化和排出,从而改善了胆固醇代谢。
代谢组学影响:血清代谢物分析显示,补充B.vulgatus Bv46 能够增强氨基酸、甘油磷脂的代谢,并对脂质代谢产生正面影响。
// 结论
Bacteroides vulgatus Bv46 通过多种机制(包括改善血脂谱、减轻全身性炎症、调节肠道微生物群、增强短链脂肪酸产生和胆汁酸代谢)证明了其在高脂血症干预中的潜力。这些发现不仅支持了B.vulgatus在宿主代谢调节中的作用,也为高脂血症的治疗提供了新的潜在策略。
5
减轻肠道炎症
• B.vulgatus有助于减轻结肠炎症状和病理损伤
有研究探讨了B.vulgatus在小鼠模型中对结肠炎的保护作用及其通过调节肠道微生物群和免疫反应的机制。
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研究发现,B.vulgatus的补充显著减轻了小鼠的结肠炎症状,包括减轻体重下降、改善粪便形态以及减少结肠病理损伤。这表明该菌株在缓解肠道炎症方面具有效果。
此外,B.vulgatus的使用还导致结肠中促炎细胞因子TNF-α、IL-1β和IL-6的表达下降,并可能通过短链脂肪酸(SCFAs)释放实现抗炎效果。
• B.vulgatus可能作为治疗溃疡性结肠炎的靶点
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另一项溃疡性结肠炎(UC)患者的多组学分析研究发表于《Nature Microbiology》,研究发现Bacteroides vulgatus来源的蛋白酶是破坏UC患者肠道屏障的一个原因,体外和体内实验均证实抑制该蛋白酶可降低小鼠结肠炎的发生。Bacteroides vulgatus分泌的蛋白酶可做为治疗UC的潜在靶点。
• 保护急性肠道损伤
还有研究探讨了不同Bacteroides vulgatus菌株对脂多糖(LPS)诱导的急性肠道损伤的保护作用。
从健康的人类粪便样本中分离出七个B.vulgatus菌株,分别命名为FTJS7K1、FTJS5K1、FSDTA11B14、FJSWX62K35、FSDLZ51K1、FBJS10K3和FGSZY37K4。
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研究发现,B.vulgatus FTJS7K1的施药能保护肠道上皮的完整性。B.vulgatus FTJS7K1还抵消了LPS诱导的结肠组织细胞因子mRNA表达变化,以及肠系膜淋巴结中调节T细胞比例的变化。
与LPS组相比,FTJS7K1 组的B.vulgatus增加了乳杆菌、阿克曼氏菌和双歧杆菌的丰度,而 Faecalibaculum 的丰度则下降。此外,B.vulgatus FTJS7K1 组的粪便样本中短链脂肪酸(SCFAs)浓度显著增加。基因组分析表明,FTJS7K1 的保护作用可能通过与防御机制和代谢相关的特定基因介导(例如 SCFA 的分泌)。
6
在骨骼健康中存在矛盾作用
有研究探讨了Bacteroides vulgatus在骨骼健康中的作用,但结果存在矛盾。例如一项研究分析了该菌株在去除卵巢小鼠模型中改善结肠微生物群失调和减轻骨质流失的潜力。
• B.vulgatus在去除卵巢小鼠中减轻骨质流失
研究发现补充B.vulgatus显著减轻了去卵巢小鼠的椎体骨质流失。这一发现表明,该菌株可能在雌激素缺乏引起的骨量减少中发挥保护作用。
B.vulgatus的施用还改善了去卵巢小鼠的结肠微生物群组成,增加了有益菌的丰度,特别是 Lactobacillus 和 Bifidobacterium 属;这些变化与骨质改善的效果相吻合。
• 下调血清戊酸、骨吸收增加
然而,在另外一项研究中发现:B.vulgatus的丰度增加会影响血清戊酸(VA)的水平,而这与骨密度呈正相关。喂食B.vulgatus的卵巢切除小鼠骨吸收增加,骨微结构变差,而喂食VA的小鼠则骨吸收减少,骨微结构改善。
总体而言,Bacteroides vulgatus对骨骼健康的影响并不是简单的有益或有害,而是取决于宿主的生理状态(如激素水平)。在雌激素缺乏的情况下,B.vulgatus的增多可能导致骨密度降低,而在改善肠道健康及抑制炎症的情况下,可能展现出一定的保护作用。因此,针对不同人群或临床情况,应谨慎评估B.vulgatus的治疗潜力。
B.vulgatus丰度过低与疾病
结合上文内容,总体来看,现有研究表明,B.vulgatus的丰度在这些疾病中普遍偏低,且这种低丰度可能与具体的健康问题存在潜在的联系。我们在下方的表格中进行了总结:
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B.vulgatus丰度过高与疾病
尽管研究发现 Bacteroides vulgatus 具有多种代谢或健康方面的益处,但同时也观察到其在某些疾病状态下,其丰度异常增高。
①自闭症患者中丰度较高
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研究发现,Bacteroides vulgatus在自闭症儿童中的丰度显著高于健康对照组,暗示其可能与自闭症症状的发展相关。这种细菌可以产生像丙酸这样的SCFA,在高浓度下可能具有神经毒性并影响行为。
②甲状腺炎患者中增加
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在 Hashimoto 甲状腺炎 (HT) 的患者群体中,B.vulgatus 的丰度显著增加,这与肠道微生物群的失衡及免疫反应激活可能相关。
与其他细菌的对比:HT 患者的肠道微生物组相比于健康对照组,显示出整体的细菌多样性和丰度改变,且B.vulgatus在特定条件下的增多可能与其他有害菌(如Escherichia-Shigella)的共存有关。
③可能是婴儿乳糜泻的风险因素
过高水平的 B. vulgatus 还被认为是婴儿乳糜泻的重要风险因素,这意味着当这种细菌在婴儿的肠道中丰度较高时,患上乳糜泻的可能性会增加。
饮食因素
B.vulgatus的种群规模对所摄入的食物高度敏感,因此饮食是影响其丰度的最重要外部因素。
•高纤维饮食:富含植物纤维和抗性淀粉的饮食能够促进B.vulgatus的生长。全谷物、豆类、蔬菜及坚果等食物能够为这种细菌提供营养,帮助其发酵并产生有益的短链脂肪酸(SCFAs),这些代谢产物对维持肠道健康和代谢调节至关重要。洋葱、大蒜、香蕉和芦笋等食物也被发现能够促进B.vulgatus丰度增加。
•发酵食品:酸奶、开菲尔、酸菜、泡菜等发酵食品也有助于支持B.vulgatus的健康生长。
•富含多酚的食物:食用富含多酚的食物,如浆果、绿茶、黑巧克力和红酒。
•减少加工食品摄入:高加工食品通常纤维含量低,会对有益细菌产生负面影响,导致肠道菌群不平衡,进而抑制 B. vulgatus 的生长。
生活方式因素
•日常锻炼:规律的身体活动有助于增强肠道微生物的多样性,从而支持B.vulgatus的丰度。
•压力管理:持续的心理压力可能对肠道健康产生负面影响。采用减压措施(如冥想、瑜伽和正念练习)有利于维护肠道微生物的平衡。
•健康的睡眠模式:保持规律的睡眠,以支持肠道微生物群的平衡。
药物与补充剂
•益生菌:考虑直接补充益生菌以增加肠道中的B.vulgatus。
•避免不必要的抗生素:仅在必要时使用抗生素,以避免破坏肠道微生物群。
主要参考文献:
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