菌群16s测序

菌群16s测序

谷禾菌群测序是通过对细菌的16s v4可变区域及部分病毒、真菌和寄生虫以及毒力和耐药基因进行靶向扩增测序，来对肠道菌群的种属和基因丰度进行检测。

肠道菌群DNA/RNA样本使用自动化移液工作站自动提取和分液后进行PCR扩增。

再经过凝胶电泳和荧光定量PCR双重质检，最终进入上机基因测序。

严格的质量和扩增管控：

• 高保真酶
• 扩增循环数控制在24循环
• 严格空白对照与阳性对照试验
• 独立barcode控制数据切分

我们的测序平台使用二代高通量测序平台。

以下是谷禾测序检测的数据参数：

检测技术及方法：

自主粪便肠道菌群取样和提取方法

高通量测序

Q30质量大于93%

平均10万reads，最低5万reads

细菌16sDNA，V4区，引物：F515-R806

70%到种，致病菌95%特异性

最低质检标准1万reads