菌群16s测序

菌群16s测序

谷禾菌群测序是通过对细菌的16s v4可变区域进行扩增测序,来对肠道菌群的种属和丰度进行检测。

肠道菌群DNA样本使用德国eppendorf公司的自动化移液工作站完全全自动提取和PCR分液后进行PCR扩增。

再经过凝胶电泳和荧光定量PCR双重质检,最终进入上机基因测序。

严格的质量和扩增管控:

  • NEB Phusion High-Fidelity 高保真酶
  • 扩增循环数控制在24循环
  • 严格空白对照与阳性对照试验
  • 独立barcode控制数据切分

我们的测序平台使用美国Illumina公司的Hiseq测序平台,也是目前世界上最主要的新一代高通量基因测序平台。

 

下面的视频是美国人类肠道菌群计划使用美国Illumina公司的测序平台进行测序分析的视频,其背后的技术和原理与谷禾相同。

以下是谷禾测序检测的数据参数:

检测技术及方法:

自主粪便肠道菌群取样和提取方法

Illumina Hiseq高通量测序

Q30质量大于93%

平均10万reads,最低5万reads

细菌16sDNA,V4区,引物:F515-R806

70%到种,致病菌95%特异性

最低质检标准1万reads

2 comments so far

    谷禾健康Posted on2:00 下午 - 5月 4, 2018

    单独的面向消费者的肠道菌群精准检测版本的产品我们马上就会上线,零售价格是150元,可以到我们的产品栏中查看。

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