菌群16s测序

菌群16s测序

谷禾菌群测序是通过对细菌的16s v4可变区域进行扩增测序，来对肠道菌群的种属和丰度进行检测。

肠道菌群DNA样本使用德国eppendorf公司的自动化移液工作站完全全自动提取和PCR分液后进行PCR扩增。

再经过凝胶电泳和荧光定量PCR双重质检，最终进入上机基因测序。

严格的质量和扩增管控：

• NEB Phusion High-Fidelity 高保真酶
• 扩增循环数控制在24循环
• 严格空白对照与阳性对照试验
• 独立barcode控制数据切分

我们的测序平台使用美国Illumina公司的Nova测序平台，也是目前世界上最主要的新一代高通量基因测序平台。

下面的视频是美国人类肠道菌群计划使用美国Illumina公司的测序平台进行测序分析的视频，其背后的技术和原理与谷禾相同。

以下是谷禾测序检测的数据参数：

检测技术及方法：

自主粪便肠道菌群取样和提取方法

Illumina Novaseq高通量测序

Q30质量大于93%

平均10万reads，最低5万reads

细菌16sDNA，V4区，引物：F515-R806

70%到种，致病菌95%特异性

最低质检标准1万reads