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谷禾最新宏基因组精准检测报告
谷禾利用16srRNA高通量测序技术,在肠道菌群检测方面已经深耕十多年,积累了丰富的经验和海量数据。
16s rRNA测序技术是一种基于细菌16s rRNA基因的微生物鉴定方法,可以快速、准确地分析肠道菌群的组成和多样性,是目前肠道菌群研究广泛使用的一种方法。
在此基础上,谷禾最新又推出肠道微生态宏基因组精准检测报告。
什么是宏基因组?
宏基因组测序也就是shotgun测序,以环境中所有微生物基因组为研究对象,通过对环境样品中的全基因组DNA进行高通量测序,获得单个样品的饱和数据量,基于denovo组装进行微生物群结构多样性,深度全面的了解微生物群体的构成,甚至获得单个菌株的完整基因组。
宏基因组检测的优缺点
优点:
宏基因组可以更加精细化开展其基因构成、分布,次生代谢合成,抗生素耐药基因及其演化,微生物群体基因组成及功能等分析。
<来源:谷禾宏基因组精准检测报告>
缺点:
总的来说,宏基因组测序仍存在技术瓶颈和生物学解释的局限性。然而,针对某些特殊情况研究需要,宏基因组测序也是一种有用的微生物组学研究工具。
特殊应用场景
对于一些复杂的多菌种感染,宏基因组能够更精细化鉴定感染菌群的构成,为临床辅助诊疗提供依据。
与传统方法相比,宏基因组学诊断真菌感染的敏感性和特异性更高,适用于一些真菌感染疾病。也可能鉴定出可疑的新病原体,为后续的病原学研究、药物和疫苗开发奠定基础。
<来源:谷禾宏基因组精准检测报告>
谷禾数据库构建
肠道菌群在人体健康和疾病中扮演着重要角色,因此构建一个完善的肠道菌群宏基因组数据库对于研究人体菌群的组成和功能具有重要意义。
宏基因组数据库的物种涵盖范围和菌株构成,直接影响着宏基因组物种鉴定分类的准确性和分类精度。
在选择合适的算法方面也是至关重要的,谷禾整合了最新的NCBI refseq数据库中包含所有细菌、病毒、真菌和寄生虫等微生物物种信息。
<来源:谷禾宏基因组精准检测报告>
接下来,我们结合谷禾宏基因组精准检测报告中的一些重要模块,包括不同微生物的相对丰度、抗生素耐药、毒力基因等重要信息,更全面的了解宏基因组精准检测报告,包括其在个性化的健康管理和治疗方案制定方面的潜力。
核心菌属
我们将在90%人群检出,人群平均丰度1%以上的菌属为核心菌属,属于人体肠道菌群中最常见和主要的菌属。核心菌属及有益菌累加占总肠道菌群比例低于60%的可能出现肠道菌群紊乱。
<来源:谷禾宏基因组精准检测报告>
有益菌
肠道内的有益菌能够调节肠道内生态平衡,促进人体健康,如双歧杆菌和乳酸杆菌,保持肠道菌群的平衡对于全面提升整体健康水平至关重要。
对于肠道菌群多样性降低、有益菌减少的肠道疾病患者,可根据其菌群特征,定制个性化的益生菌组合,精准调控肠道菌群。
<来源:谷禾宏基因组精准检测报告>
有害菌
了解与疾病相关的有害菌,为辅助诊断和治疗提供依据。例如,对于肠道菌群失衡、有害菌明显增多的患者,可根据其菌群特征,结合其已有的症状,采取个性化的饮食、益生菌、靶向抗菌等综合干预措施,精准调控干预,恢复菌群平衡。
<来源:谷禾宏基因组精准检测报告>
机会致病菌
机会致病菌在肠道内广泛分布,是正常肠道菌群的一部分,但当这类菌过多或免疫力下降时有可能会引发疾病,如大肠埃希氏菌。
<来源:谷禾宏基因组精准检测报告>
抗生素耐药
宏基因组对抗生素耐药研究也有意义,可以加深对耐药机制的认识,为临床上抗生素干预的选择提供帮助。
分析耐药基因
宏基因组测序可获得细菌群体的全部基因组信息,通过序列比对和功能注释,可鉴定出各种已知和新型耐药基因,全面评估耐药基因的种类和数量。例如,在人体肠道宏基因组中发现了大量β-内酰胺酶等耐药基因。
<来源:谷禾宏基因组精准检测报告>
追踪耐药基因的传播途径
通过比较不同环境(如土壤、水体、动物和人体)中耐药基因的分布情况,可推测耐药基因的来源和传播途径。
辅助指导耐药风险评估和防控策略
宏基因组学评估环境和宿主中耐药基因的分布特点,识别高风险区域和人群,为制定针对性的监测和干预措施提供依据。
毒力基因
宏基因组检测技术在病原微生物毒力基因研究中具有独特优势,可在基因组水平系统分析其毒力基因组成及调控网络,加深对致病机理的理解。
<来源:谷禾宏基因组精准检测报告>
以上是谷禾宏基因组精准检测报告的一些节选,其全面、精准、个性化分析肠道菌群的组成和功能,可帮助评估菌群失衡的风险和预后,为个性化诊疗和健康管理提供科学依据。