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RESCRIPt:序列分类参考数据库管理工具

谷禾健康 分类分析的研究,依赖于高质量的序列分类参考数据库,然而,目前已有记录公共序列数据库中出现错误,这些错误可能导致下游结果出错。不同的参考数据库对生物数据的分类结果差别很大

肠道菌群健康检测报告——常见问题解析

谷禾健康 在持续的肠道菌群检测实践过程中,我们收到很多新的问题反馈和对肠道菌群检测在具体问题中的疑问。在此谷禾基于长期和大规模样本群的经验以及实验分析,对部分常见问题进行汇总和整

新方法工具 | 标准化注释细菌基因组

谷禾健康 在细菌全基因组测序数据分析中,区域(regional)和功能注释已经成为常规操作。一个完整的基因组注释是下游分析的基础,而注释的准确性和全面性往往影响研究结果。 ​ 最近来自德国一

人类微生物组研究报告——规范流程

谷禾健康 人类微生物组的变化与许多疾病和健康状况有关。然而,看懂人类微生物组研究结果的报告具有挑战性,因为它通常涉及微生物学、基因组学、生物医学、生物信息学、统计学、流行病学等领

关于《CELL》最新研究:饮食,自闭症与肠道菌群的疑惑与讨论

谷禾健康 本文原创:谷禾健康 自闭症谱系障碍是一种神经发育疾病,其特征是社交和沟通困难、限制性和重复性行为以及异常的感觉反应。 自闭症的具体发病机制尚不能明确,但目前为止许多研究

微生物组和组学成分数据分析之ALR对数转换

谷禾健康 编辑​ 微生物组和组学数据集,由于其生物学性质,通常是高维的,特征常以各种成分,如基因、OTU、RNA转录本等的计数为特征。这些数据统称为成分数据。 这类数据分析的中心概念是对

换个角度看“三胎” | 胎次影响母婴肠道菌群

谷禾健康 生?还是不生?  随着三胎政策到来,关于三胎的话题源源不断: 包括显而易见的经济压力,职场男女是否平等,教育是否能跟上,住房是否得到保障,医疗问题,家庭关系,产后

焦虑可能与食品添加剂有关,警惕食品添加剂引起微生物群变化

谷禾健康 有没有发现我们吃的食品正在变得越来越鲜艳,让人有食欲,“低脂”、“无糖”等字眼出现的频率越来越高,然而这其中必然会用到各类食品添加剂,如防腐剂,甜味剂,乳化剂,着色剂,

肠道菌群失衡的症状、原因和自然改善

谷禾健康 ​肠道菌群是居住在肠道中各种微生物。微生物群的建立甚至在个体出生之前就开始了,随着时间的推移而改变,并在体内持续存在,直到个体死亡。这些微生物群的组成是宿主特定的,在

便便之旅,了解和关注便便

谷禾健康 写在前面排便行为虽然是人类普遍存在的经历,但我们一般很少提及这个生理过程,开启“便便”这个话题并不是容易的事。如果可以抛开偏见,厌恶或者羞耻感,或许你可以尝试去了解更多这方

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